Protein–RNA interactions for Protein: P11844

CRYGA, Gamma-crystallin A, humanhuman

Predictions only

Length 174 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRYGAP11844 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CRYGAP11844 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CRYGAP11844 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CRYGAP11844 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CRYGAP11844 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CRYGAP11844 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CRYGAP11844 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CRYGAP11844 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CRYGAP11844 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CRYGAP11844 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CRYGAP11844 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CRYGAP11844 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CRYGAP11844 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CRYGAP11844 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CRYGAP11844 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CRYGAP11844 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CRYGAP11844 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CRYGAP11844 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CRYGAP11844 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CRYGAP11844 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CRYGAP11844 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CRYGAP11844 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CRYGAP11844 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CRYGAP11844 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CRYGAP11844 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CRYGAP11844 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CRYGAP11844 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CRYGAP11844 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CRYGAP11844 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CRYGAP11844 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CRYGAP11844 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CRYGAP11844 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CRYGAP11844 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CRYGAP11844 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CRYGAP11844 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CRYGAP11844 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CRYGAP11844 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CRYGAP11844 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CRYGAP11844 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CRYGAP11844 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CRYGAP11844 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CRYGAP11844 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CRYGAP11844 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CRYGAP11844 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CRYGAP11844 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CRYGAP11844 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CRYGAP11844 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CRYGAP11844 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CRYGAP11844 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CRYGAP11844 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CRYGAP11844 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CRYGAP11844 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CRYGAP11844 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CRYGAP11844 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CRYGAP11844 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CRYGAP11844 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CRYGAP11844 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CRYGAP11844 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CRYGAP11844 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CRYGAP11844 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CRYGAP11844 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CRYGAP11844 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CRYGAP11844 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CRYGAP11844 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CRYGAP11844 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CRYGAP11844 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CRYGAP11844 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CRYGAP11844 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CRYGAP11844 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CRYGAP11844 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CRYGAP11844 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CRYGAP11844 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CRYGAP11844 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CRYGAP11844 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CRYGAP11844 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CRYGAP11844 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CRYGAP11844 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CRYGAP11844 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CRYGAP11844 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CRYGAP11844 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CRYGAP11844 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CRYGAP11844 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CRYGAP11844 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CRYGAP11844 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CRYGAP11844 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CRYGAP11844 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CRYGAP11844 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CRYGAP11844 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CRYGAP11844 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CRYGAP11844 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CRYGAP11844 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CRYGAP11844 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CRYGAP11844 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CRYGAP11844 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CRYGAP11844 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CRYGAP11844 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CRYGAP11844 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CRYGAP11844 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CRYGAP11844 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CRYGAP11844 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.7 ms