Protein–RNA interactions for Protein: P11802

CDK4, Cyclin-dependent kinase 4, humanhuman

Predictions only

Length 303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK4P11802 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CDK4P11802 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
CDK4P11802 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CDK4P11802 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CDK4P11802 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CDK4P11802 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CDK4P11802 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CDK4P11802 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CDK4P11802 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CDK4P11802 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
CDK4P11802 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CDK4P11802 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CDK4P11802 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CDK4P11802 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CDK4P11802 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CDK4P11802 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CDK4P11802 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CDK4P11802 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CDK4P11802 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CDK4P11802 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CDK4P11802 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CDK4P11802 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CDK4P11802 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CDK4P11802 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CDK4P11802 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.2■■□□□ 1.47
CDK4P11802 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CDK4P11802 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CDK4P11802 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
CDK4P11802 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CDK4P11802 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CDK4P11802 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CDK4P11802 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CDK4P11802 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CDK4P11802 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
CDK4P11802 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
CDK4P11802 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
CDK4P11802 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CDK4P11802 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CDK4P11802 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
CDK4P11802 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CDK4P11802 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CDK4P11802 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CDK4P11802 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CDK4P11802 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CDK4P11802 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CDK4P11802 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CDK4P11802 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CDK4P11802 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CDK4P11802 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CDK4P11802 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CDK4P11802 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CDK4P11802 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CDK4P11802 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
CDK4P11802 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CDK4P11802 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CDK4P11802 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CDK4P11802 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CDK4P11802 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CDK4P11802 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CDK4P11802 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CDK4P11802 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CDK4P11802 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CDK4P11802 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CDK4P11802 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CDK4P11802 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CDK4P11802 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CDK4P11802 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CDK4P11802 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CDK4P11802 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CDK4P11802 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CDK4P11802 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CDK4P11802 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CDK4P11802 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CDK4P11802 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
CDK4P11802 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CDK4P11802 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CDK4P11802 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CDK4P11802 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CDK4P11802 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CDK4P11802 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CDK4P11802 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CDK4P11802 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
CDK4P11802 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CDK4P11802 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CDK4P11802 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CDK4P11802 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CDK4P11802 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CDK4P11802 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CDK4P11802 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
CDK4P11802 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CDK4P11802 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CDK4P11802 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CDK4P11802 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
CDK4P11802 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CDK4P11802 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CDK4P11802 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
CDK4P11802 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
CDK4P11802 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CDK4P11802 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CDK4P11802 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms