Protein–RNA interactions for Protein: P10589

NR2F1, COUP transcription factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 423 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR2F1P10589 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NR2F1P10589 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NR2F1P10589 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NR2F1P10589 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NR2F1P10589 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NR2F1P10589 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NR2F1P10589 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NR2F1P10589 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NR2F1P10589 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NR2F1P10589 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NR2F1P10589 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NR2F1P10589 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NR2F1P10589 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NR2F1P10589 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NR2F1P10589 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NR2F1P10589 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NR2F1P10589 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NR2F1P10589 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NR2F1P10589 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NR2F1P10589 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
NR2F1P10589 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NR2F1P10589 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NR2F1P10589 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NR2F1P10589 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NR2F1P10589 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NR2F1P10589 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
NR2F1P10589 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NR2F1P10589 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NR2F1P10589 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
NR2F1P10589 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
NR2F1P10589 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
NR2F1P10589 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
NR2F1P10589 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
NR2F1P10589 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NR2F1P10589 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NR2F1P10589 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NR2F1P10589 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NR2F1P10589 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
NR2F1P10589 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NR2F1P10589 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NR2F1P10589 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NR2F1P10589 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NR2F1P10589 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NR2F1P10589 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NR2F1P10589 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NR2F1P10589 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NR2F1P10589 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NR2F1P10589 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NR2F1P10589 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NR2F1P10589 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NR2F1P10589 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NR2F1P10589 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NR2F1P10589 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NR2F1P10589 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NR2F1P10589 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NR2F1P10589 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NR2F1P10589 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NR2F1P10589 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NR2F1P10589 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
NR2F1P10589 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NR2F1P10589 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NR2F1P10589 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NR2F1P10589 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
NR2F1P10589 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NR2F1P10589 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
NR2F1P10589 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NR2F1P10589 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NR2F1P10589 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NR2F1P10589 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NR2F1P10589 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NR2F1P10589 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NR2F1P10589 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NR2F1P10589 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NR2F1P10589 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NR2F1P10589 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NR2F1P10589 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NR2F1P10589 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NR2F1P10589 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NR2F1P10589 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NR2F1P10589 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NR2F1P10589 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NR2F1P10589 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NR2F1P10589 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NR2F1P10589 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NR2F1P10589 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NR2F1P10589 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NR2F1P10589 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NR2F1P10589 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NR2F1P10589 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NR2F1P10589 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NR2F1P10589 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NR2F1P10589 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
NR2F1P10589 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NR2F1P10589 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
NR2F1P10589 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NR2F1P10589 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NR2F1P10589 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NR2F1P10589 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NR2F1P10589 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NR2F1P10589 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.3 ms