Protein–RNA interactions for Protein: P10276

RARA, Retinoic acid receptor alpha, humanhuman

Predictions only

Length 462 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RARAP10276 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
RARAP10276 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RARAP10276 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RARAP10276 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RARAP10276 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
RARAP10276 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RARAP10276 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
RARAP10276 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RARAP10276 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
RARAP10276 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RARAP10276 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
RARAP10276 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RARAP10276 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
RARAP10276 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
RARAP10276 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
RARAP10276 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RARAP10276 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RARAP10276 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
RARAP10276 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RARAP10276 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RARAP10276 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RARAP10276 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
RARAP10276 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
RARAP10276 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RARAP10276 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
RARAP10276 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
RARAP10276 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
RARAP10276 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
RARAP10276 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
RARAP10276 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
RARAP10276 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
RARAP10276 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
RARAP10276 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
RARAP10276 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
RARAP10276 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
RARAP10276 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
RARAP10276 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
RARAP10276 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
RARAP10276 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
RARAP10276 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
RARAP10276 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
RARAP10276 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
RARAP10276 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
RARAP10276 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
RARAP10276 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
RARAP10276 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
RARAP10276 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
RARAP10276 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
RARAP10276 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
RARAP10276 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
RARAP10276 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
RARAP10276 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
RARAP10276 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
RARAP10276 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
RARAP10276 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
RARAP10276 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
RARAP10276 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
RARAP10276 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
RARAP10276 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
RARAP10276 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
RARAP10276 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
RARAP10276 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
RARAP10276 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
RARAP10276 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
RARAP10276 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
RARAP10276 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
RARAP10276 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
RARAP10276 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
RARAP10276 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
RARAP10276 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
RARAP10276 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
RARAP10276 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
RARAP10276 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
RARAP10276 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
RARAP10276 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
RARAP10276 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
RARAP10276 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
RARAP10276 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
RARAP10276 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
RARAP10276 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
RARAP10276 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
RARAP10276 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
RARAP10276 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
RARAP10276 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
RARAP10276 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
RARAP10276 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
RARAP10276 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
RARAP10276 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
RARAP10276 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
RARAP10276 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
RARAP10276 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
RARAP10276 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
RARAP10276 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
RARAP10276 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
RARAP10276 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
RARAP10276 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
RARAP10276 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
RARAP10276 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
RARAP10276 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
RARAP10276 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.9 ms