Protein–RNA interactions for Protein: P0DJD1

RGPD2, RANBP2-like and GRIP domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGPD2P0DJD1 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC32.9■■■□□ 2.86
RGPD2P0DJD1 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
RGPD2P0DJD1 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC32.9■■■□□ 2.86
RGPD2P0DJD1 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC32.9■■■□□ 2.86
RGPD2P0DJD1 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
RGPD2P0DJD1 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.89■■■□□ 2.86
RGPD2P0DJD1 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC32.89■■■□□ 2.86
RGPD2P0DJD1 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
RGPD2P0DJD1 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
RGPD2P0DJD1 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC32.88■■■□□ 2.85
RGPD2P0DJD1 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC32.88■■■□□ 2.85
RGPD2P0DJD1 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.88■■■□□ 2.85
RGPD2P0DJD1 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC32.87■■■□□ 2.85
RGPD2P0DJD1 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
RGPD2P0DJD1 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
RGPD2P0DJD1 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC32.86■■■□□ 2.85
RGPD2P0DJD1 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC32.86■■■□□ 2.85
RGPD2P0DJD1 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC32.86■■■□□ 2.85
RGPD2P0DJD1 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.86■■■□□ 2.85
RGPD2P0DJD1 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC32.86■■■□□ 2.85
RGPD2P0DJD1 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
RGPD2P0DJD1 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.86■■■□□ 2.85
RGPD2P0DJD1 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
RGPD2P0DJD1 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC32.85■■■□□ 2.85
RGPD2P0DJD1 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
RGPD2P0DJD1 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.84■■■□□ 2.85
RGPD2P0DJD1 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.83■■■□□ 2.85
RGPD2P0DJD1 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC32.83■■■□□ 2.85
RGPD2P0DJD1 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
RGPD2P0DJD1 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC32.83■■■□□ 2.85
RGPD2P0DJD1 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC32.83■■■□□ 2.85
RGPD2P0DJD1 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
RGPD2P0DJD1 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
RGPD2P0DJD1 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC32.81■■■□□ 2.84
RGPD2P0DJD1 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC32.81■■■□□ 2.84
RGPD2P0DJD1 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
RGPD2P0DJD1 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC32.81■■■□□ 2.84
RGPD2P0DJD1 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC32.8■■■□□ 2.84
RGPD2P0DJD1 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
RGPD2P0DJD1 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.79■■■□□ 2.84
RGPD2P0DJD1 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
RGPD2P0DJD1 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
RGPD2P0DJD1 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.79■■■□□ 2.84
RGPD2P0DJD1 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
RGPD2P0DJD1 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC32.78■■■□□ 2.84
RGPD2P0DJD1 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.78■■■□□ 2.84
RGPD2P0DJD1 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC32.78■■■□□ 2.84
RGPD2P0DJD1 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
RGPD2P0DJD1 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC32.78■■■□□ 2.84
RGPD2P0DJD1 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC32.78■■■□□ 2.84
RGPD2P0DJD1 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
RGPD2P0DJD1 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC32.77■■■□□ 2.84
RGPD2P0DJD1 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.84
RGPD2P0DJD1 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.84
RGPD2P0DJD1 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
RGPD2P0DJD1 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC32.75■■■□□ 2.83
RGPD2P0DJD1 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
RGPD2P0DJD1 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
RGPD2P0DJD1 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
RGPD2P0DJD1 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
RGPD2P0DJD1 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
RGPD2P0DJD1 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
RGPD2P0DJD1 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
RGPD2P0DJD1 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
RGPD2P0DJD1 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC32.74■■■□□ 2.83
RGPD2P0DJD1 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
RGPD2P0DJD1 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
RGPD2P0DJD1 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
RGPD2P0DJD1 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.73■■■□□ 2.83
RGPD2P0DJD1 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
RGPD2P0DJD1 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC32.73■■■□□ 2.83
RGPD2P0DJD1 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
RGPD2P0DJD1 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC32.73■■■□□ 2.83
RGPD2P0DJD1 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.72■■■□□ 2.83
RGPD2P0DJD1 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC32.72■■■□□ 2.83
RGPD2P0DJD1 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
RGPD2P0DJD1 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC32.72■■■□□ 2.83
RGPD2P0DJD1 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
RGPD2P0DJD1 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
RGPD2P0DJD1 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC32.71■■■□□ 2.83
RGPD2P0DJD1 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
RGPD2P0DJD1 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.7■■■□□ 2.83
RGPD2P0DJD1 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC32.7■■■□□ 2.83
RGPD2P0DJD1 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
RGPD2P0DJD1 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.82
RGPD2P0DJD1 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC32.7■■■□□ 2.82
RGPD2P0DJD1 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.69■■■□□ 2.82
RGPD2P0DJD1 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC32.69■■■□□ 2.82
RGPD2P0DJD1 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC32.69■■■□□ 2.82
RGPD2P0DJD1 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
RGPD2P0DJD1 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
RGPD2P0DJD1 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
RGPD2P0DJD1 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.68■■■□□ 2.82
RGPD2P0DJD1 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC32.68■■■□□ 2.82
RGPD2P0DJD1 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC32.68■■■□□ 2.82
RGPD2P0DJD1 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC32.67■■■□□ 2.82
RGPD2P0DJD1 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
RGPD2P0DJD1 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
RGPD2P0DJD1 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
RGPD2P0DJD1 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms