Protein–RNA interactions for Protein: P0C7U0

ELFN1, Protein ELFN1, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELFN1P0C7U0 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ELFN1P0C7U0 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ELFN1P0C7U0 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ELFN1P0C7U0 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
ELFN1P0C7U0 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ELFN1P0C7U0 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ELFN1P0C7U0 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ELFN1P0C7U0 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ELFN1P0C7U0 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ELFN1P0C7U0 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ELFN1P0C7U0 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ELFN1P0C7U0 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ELFN1P0C7U0 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ELFN1P0C7U0 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ELFN1P0C7U0 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ELFN1P0C7U0 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ELFN1P0C7U0 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ELFN1P0C7U0 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ELFN1P0C7U0 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ELFN1P0C7U0 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
ELFN1P0C7U0 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ELFN1P0C7U0 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ELFN1P0C7U0 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ELFN1P0C7U0 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ELFN1P0C7U0 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ELFN1P0C7U0 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ELFN1P0C7U0 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ELFN1P0C7U0 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ELFN1P0C7U0 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ELFN1P0C7U0 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ELFN1P0C7U0 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ELFN1P0C7U0 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
ELFN1P0C7U0 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ELFN1P0C7U0 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ELFN1P0C7U0 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
ELFN1P0C7U0 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ELFN1P0C7U0 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ELFN1P0C7U0 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ELFN1P0C7U0 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
ELFN1P0C7U0 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ELFN1P0C7U0 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ELFN1P0C7U0 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ELFN1P0C7U0 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ELFN1P0C7U0 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ELFN1P0C7U0 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ELFN1P0C7U0 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ELFN1P0C7U0 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ELFN1P0C7U0 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ELFN1P0C7U0 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ELFN1P0C7U0 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ELFN1P0C7U0 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
ELFN1P0C7U0 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
ELFN1P0C7U0 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ELFN1P0C7U0 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ELFN1P0C7U0 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ELFN1P0C7U0 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
ELFN1P0C7U0 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ELFN1P0C7U0 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ELFN1P0C7U0 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ELFN1P0C7U0 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
ELFN1P0C7U0 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ELFN1P0C7U0 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ELFN1P0C7U0 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ELFN1P0C7U0 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ELFN1P0C7U0 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ELFN1P0C7U0 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ELFN1P0C7U0 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ELFN1P0C7U0 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ELFN1P0C7U0 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ELFN1P0C7U0 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ELFN1P0C7U0 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
ELFN1P0C7U0 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ELFN1P0C7U0 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
ELFN1P0C7U0 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
ELFN1P0C7U0 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ELFN1P0C7U0 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ELFN1P0C7U0 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ELFN1P0C7U0 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ELFN1P0C7U0 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ELFN1P0C7U0 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ELFN1P0C7U0 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ELFN1P0C7U0 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ELFN1P0C7U0 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ELFN1P0C7U0 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ELFN1P0C7U0 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ELFN1P0C7U0 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ELFN1P0C7U0 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ELFN1P0C7U0 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ELFN1P0C7U0 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ELFN1P0C7U0 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ELFN1P0C7U0 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ELFN1P0C7U0 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ELFN1P0C7U0 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ELFN1P0C7U0 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ELFN1P0C7U0 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ELFN1P0C7U0 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ELFN1P0C7U0 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ELFN1P0C7U0 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ELFN1P0C7U0 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
ELFN1P0C7U0 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.2 ms