Protein–RNA interactions for Protein: P09669

COX6C, Cytochrome c oxidase subunit 6C, humanhuman

Predictions only

Length 75 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COX6CP09669 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
COX6CP09669 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
COX6CP09669 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
COX6CP09669 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
COX6CP09669 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
COX6CP09669 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
COX6CP09669 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
COX6CP09669 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
COX6CP09669 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
COX6CP09669 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
COX6CP09669 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
COX6CP09669 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
COX6CP09669 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
COX6CP09669 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
COX6CP09669 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
COX6CP09669 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
COX6CP09669 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
COX6CP09669 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
COX6CP09669 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
COX6CP09669 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
COX6CP09669 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
COX6CP09669 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
COX6CP09669 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
COX6CP09669 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
COX6CP09669 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
COX6CP09669 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
COX6CP09669 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
COX6CP09669 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
COX6CP09669 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
COX6CP09669 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
COX6CP09669 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
COX6CP09669 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
COX6CP09669 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
COX6CP09669 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
COX6CP09669 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
COX6CP09669 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
COX6CP09669 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
COX6CP09669 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
COX6CP09669 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
COX6CP09669 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
COX6CP09669 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
COX6CP09669 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
COX6CP09669 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
COX6CP09669 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
COX6CP09669 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
COX6CP09669 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
COX6CP09669 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
COX6CP09669 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
COX6CP09669 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
COX6CP09669 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
COX6CP09669 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
COX6CP09669 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
COX6CP09669 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
COX6CP09669 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
COX6CP09669 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
COX6CP09669 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
COX6CP09669 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
COX6CP09669 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
COX6CP09669 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
COX6CP09669 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
COX6CP09669 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
COX6CP09669 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
COX6CP09669 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
COX6CP09669 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
COX6CP09669 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
COX6CP09669 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
COX6CP09669 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
COX6CP09669 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
COX6CP09669 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
COX6CP09669 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
COX6CP09669 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
COX6CP09669 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
COX6CP09669 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
COX6CP09669 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
COX6CP09669 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
COX6CP09669 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
COX6CP09669 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
COX6CP09669 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
COX6CP09669 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
COX6CP09669 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
COX6CP09669 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
COX6CP09669 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
COX6CP09669 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
COX6CP09669 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
COX6CP09669 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
COX6CP09669 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
COX6CP09669 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
COX6CP09669 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
COX6CP09669 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
COX6CP09669 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
COX6CP09669 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
COX6CP09669 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
COX6CP09669 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
COX6CP09669 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
COX6CP09669 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
COX6CP09669 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
COX6CP09669 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
COX6CP09669 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
COX6CP09669 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
COX6CP09669 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.1 ms