Protein–RNA interactions for Protein: P09067

HOXB5, Homeobox protein Hox-B5, humanhuman

Predictions only

Length 269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB5P09067 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
HOXB5P09067 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
HOXB5P09067 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
HOXB5P09067 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
HOXB5P09067 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
HOXB5P09067 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
HOXB5P09067 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
HOXB5P09067 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
HOXB5P09067 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
HOXB5P09067 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
HOXB5P09067 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
HOXB5P09067 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
HOXB5P09067 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
HOXB5P09067 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
HOXB5P09067 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
HOXB5P09067 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
HOXB5P09067 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
HOXB5P09067 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
HOXB5P09067 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
HOXB5P09067 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
HOXB5P09067 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
HOXB5P09067 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
HOXB5P09067 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
HOXB5P09067 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
HOXB5P09067 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
HOXB5P09067 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
HOXB5P09067 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
HOXB5P09067 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HOXB5P09067 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HOXB5P09067 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HOXB5P09067 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HOXB5P09067 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HOXB5P09067 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HOXB5P09067 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
HOXB5P09067 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HOXB5P09067 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HOXB5P09067 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HOXB5P09067 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HOXB5P09067 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
HOXB5P09067 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HOXB5P09067 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
HOXB5P09067 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HOXB5P09067 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
HOXB5P09067 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HOXB5P09067 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
HOXB5P09067 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
HOXB5P09067 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
HOXB5P09067 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HOXB5P09067 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HOXB5P09067 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
HOXB5P09067 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
HOXB5P09067 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
HOXB5P09067 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
HOXB5P09067 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HOXB5P09067 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
HOXB5P09067 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HOXB5P09067 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HOXB5P09067 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HOXB5P09067 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HOXB5P09067 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HOXB5P09067 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HOXB5P09067 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HOXB5P09067 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HOXB5P09067 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HOXB5P09067 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HOXB5P09067 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HOXB5P09067 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HOXB5P09067 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HOXB5P09067 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HOXB5P09067 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
HOXB5P09067 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HOXB5P09067 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HOXB5P09067 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HOXB5P09067 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HOXB5P09067 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HOXB5P09067 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HOXB5P09067 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HOXB5P09067 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HOXB5P09067 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HOXB5P09067 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HOXB5P09067 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HOXB5P09067 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HOXB5P09067 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
HOXB5P09067 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HOXB5P09067 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HOXB5P09067 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HOXB5P09067 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HOXB5P09067 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
HOXB5P09067 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HOXB5P09067 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HOXB5P09067 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HOXB5P09067 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HOXB5P09067 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HOXB5P09067 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HOXB5P09067 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HOXB5P09067 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HOXB5P09067 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
HOXB5P09067 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HOXB5P09067 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HOXB5P09067 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms