Protein–RNA interactions for Protein: P08237

PFKM, ATP-dependent 6-phosphofructokinase, muscle type, humanhuman

Predictions only

Length 780 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PFKMP08237 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
PFKMP08237 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
PFKMP08237 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
PFKMP08237 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
PFKMP08237 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
PFKMP08237 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC27.26■■□□□ 1.95
PFKMP08237 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
PFKMP08237 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
PFKMP08237 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
PFKMP08237 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PFKMP08237 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
PFKMP08237 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
PFKMP08237 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
PFKMP08237 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
PFKMP08237 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
PFKMP08237 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PFKMP08237 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
PFKMP08237 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
PFKMP08237 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PFKMP08237 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PFKMP08237 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PFKMP08237 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
PFKMP08237 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
PFKMP08237 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
PFKMP08237 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
PFKMP08237 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PFKMP08237 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PFKMP08237 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PFKMP08237 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
PFKMP08237 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
PFKMP08237 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
PFKMP08237 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
PFKMP08237 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
PFKMP08237 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
PFKMP08237 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PFKMP08237 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
PFKMP08237 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
PFKMP08237 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PFKMP08237 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PFKMP08237 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PFKMP08237 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
PFKMP08237 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PFKMP08237 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PFKMP08237 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PFKMP08237 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PFKMP08237 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
PFKMP08237 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PFKMP08237 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PFKMP08237 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PFKMP08237 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PFKMP08237 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PFKMP08237 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
PFKMP08237 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
PFKMP08237 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PFKMP08237 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
PFKMP08237 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
PFKMP08237 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
PFKMP08237 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
PFKMP08237 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
PFKMP08237 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
PFKMP08237 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
PFKMP08237 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PFKMP08237 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PFKMP08237 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PFKMP08237 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
PFKMP08237 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
PFKMP08237 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PFKMP08237 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
PFKMP08237 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PFKMP08237 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
PFKMP08237 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PFKMP08237 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
PFKMP08237 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
PFKMP08237 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
PFKMP08237 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PFKMP08237 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PFKMP08237 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PFKMP08237 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PFKMP08237 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
PFKMP08237 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PFKMP08237 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PFKMP08237 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PFKMP08237 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
PFKMP08237 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PFKMP08237 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PFKMP08237 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PFKMP08237 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PFKMP08237 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
PFKMP08237 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
PFKMP08237 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
PFKMP08237 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC27.08■■□□□ 1.93
PFKMP08237 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
PFKMP08237 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
PFKMP08237 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PFKMP08237 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
PFKMP08237 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
PFKMP08237 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
PFKMP08237 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
PFKMP08237 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PFKMP08237 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms