Protein–RNA interactions for Protein: P07358

C8B, Complement component C8 beta chain, humanhuman

Predictions only

Length 591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C8BP07358 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
C8BP07358 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
C8BP07358 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
C8BP07358 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
C8BP07358 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
C8BP07358 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
C8BP07358 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
C8BP07358 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
C8BP07358 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
C8BP07358 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
C8BP07358 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
C8BP07358 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
C8BP07358 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
C8BP07358 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
C8BP07358 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
C8BP07358 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
C8BP07358 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
C8BP07358 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
C8BP07358 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
C8BP07358 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
C8BP07358 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
C8BP07358 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
C8BP07358 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
C8BP07358 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
C8BP07358 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
C8BP07358 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
C8BP07358 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
C8BP07358 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
C8BP07358 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
C8BP07358 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
C8BP07358 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
C8BP07358 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
C8BP07358 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
C8BP07358 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
C8BP07358 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
C8BP07358 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
C8BP07358 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
C8BP07358 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
C8BP07358 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
C8BP07358 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
C8BP07358 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
C8BP07358 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
C8BP07358 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
C8BP07358 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
C8BP07358 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
C8BP07358 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
C8BP07358 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
C8BP07358 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
C8BP07358 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
C8BP07358 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
C8BP07358 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
C8BP07358 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
C8BP07358 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
C8BP07358 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
C8BP07358 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
C8BP07358 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
C8BP07358 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
C8BP07358 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
C8BP07358 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
C8BP07358 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
C8BP07358 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
C8BP07358 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
C8BP07358 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
C8BP07358 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
C8BP07358 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
C8BP07358 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
C8BP07358 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
C8BP07358 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
C8BP07358 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
C8BP07358 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
C8BP07358 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
C8BP07358 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
C8BP07358 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
C8BP07358 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
C8BP07358 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
C8BP07358 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
C8BP07358 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
C8BP07358 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
C8BP07358 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
C8BP07358 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
C8BP07358 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
C8BP07358 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
C8BP07358 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
C8BP07358 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
C8BP07358 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
C8BP07358 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
C8BP07358 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
C8BP07358 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
C8BP07358 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
C8BP07358 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
C8BP07358 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
C8BP07358 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
C8BP07358 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
C8BP07358 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
C8BP07358 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
C8BP07358 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
C8BP07358 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
C8BP07358 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
C8BP07358 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
C8BP07358 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms