Protein–RNA interactions for Protein: P05204

HMGN2, Non-histone chromosomal protein HMG-17, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 90 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGN2P05204 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HMGN2P05204 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HMGN2P05204 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HMGN2P05204 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HMGN2P05204 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
HMGN2P05204 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
HMGN2P05204 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HMGN2P05204 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
HMGN2P05204 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
HMGN2P05204 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HMGN2P05204 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HMGN2P05204 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HMGN2P05204 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HMGN2P05204 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HMGN2P05204 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HMGN2P05204 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HMGN2P05204 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HMGN2P05204 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HMGN2P05204 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
HMGN2P05204 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HMGN2P05204 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HMGN2P05204 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HMGN2P05204 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
HMGN2P05204 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
HMGN2P05204 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HMGN2P05204 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
HMGN2P05204 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
HMGN2P05204 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
HMGN2P05204 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
HMGN2P05204 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
HMGN2P05204 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
HMGN2P05204 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
HMGN2P05204 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
HMGN2P05204 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
HMGN2P05204 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HMGN2P05204 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HMGN2P05204 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HMGN2P05204 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HMGN2P05204 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HMGN2P05204 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HMGN2P05204 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HMGN2P05204 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HMGN2P05204 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HMGN2P05204 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HMGN2P05204 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HMGN2P05204 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HMGN2P05204 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HMGN2P05204 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HMGN2P05204 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HMGN2P05204 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HMGN2P05204 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HMGN2P05204 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HMGN2P05204 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HMGN2P05204 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HMGN2P05204 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HMGN2P05204 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HMGN2P05204 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
HMGN2P05204 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
HMGN2P05204 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HMGN2P05204 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HMGN2P05204 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HMGN2P05204 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
HMGN2P05204 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
HMGN2P05204 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
HMGN2P05204 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
HMGN2P05204 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
HMGN2P05204 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.83■■□□□ 1.24
HMGN2P05204 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.24
HMGN2P05204 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HMGN2P05204 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HMGN2P05204 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HMGN2P05204 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HMGN2P05204 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HMGN2P05204 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HMGN2P05204 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HMGN2P05204 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HMGN2P05204 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HMGN2P05204 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HMGN2P05204 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HMGN2P05204 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HMGN2P05204 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HMGN2P05204 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HMGN2P05204 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HMGN2P05204 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HMGN2P05204 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HMGN2P05204 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HMGN2P05204 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HMGN2P05204 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HMGN2P05204 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HMGN2P05204 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HMGN2P05204 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HMGN2P05204 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HMGN2P05204 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HMGN2P05204 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HMGN2P05204 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HMGN2P05204 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HMGN2P05204 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HMGN2P05204 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HMGN2P05204 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HMGN2P05204 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.3 ms