Protein–RNA interactions for Protein: P02654

APOC1, Apolipoprotein C-I, humanhuman

Predictions only

Length 83 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOC1P02654 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
APOC1P02654 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
APOC1P02654 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
APOC1P02654 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
APOC1P02654 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
APOC1P02654 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
APOC1P02654 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
APOC1P02654 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
APOC1P02654 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
APOC1P02654 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
APOC1P02654 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
APOC1P02654 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
APOC1P02654 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
APOC1P02654 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
APOC1P02654 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
APOC1P02654 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
APOC1P02654 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
APOC1P02654 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
APOC1P02654 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
APOC1P02654 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
APOC1P02654 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
APOC1P02654 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
APOC1P02654 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
APOC1P02654 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
APOC1P02654 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
APOC1P02654 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
APOC1P02654 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
APOC1P02654 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
APOC1P02654 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
APOC1P02654 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
APOC1P02654 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
APOC1P02654 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
APOC1P02654 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
APOC1P02654 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
APOC1P02654 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
APOC1P02654 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
APOC1P02654 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
APOC1P02654 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
APOC1P02654 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
APOC1P02654 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
APOC1P02654 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
APOC1P02654 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
APOC1P02654 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
APOC1P02654 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
APOC1P02654 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
APOC1P02654 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
APOC1P02654 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
APOC1P02654 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
APOC1P02654 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
APOC1P02654 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
APOC1P02654 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
APOC1P02654 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
APOC1P02654 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
APOC1P02654 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
APOC1P02654 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
APOC1P02654 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
APOC1P02654 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
APOC1P02654 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
APOC1P02654 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
APOC1P02654 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
APOC1P02654 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
APOC1P02654 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
APOC1P02654 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
APOC1P02654 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
APOC1P02654 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
APOC1P02654 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
APOC1P02654 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
APOC1P02654 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
APOC1P02654 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
APOC1P02654 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
APOC1P02654 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
APOC1P02654 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
APOC1P02654 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
APOC1P02654 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
APOC1P02654 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
APOC1P02654 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
APOC1P02654 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
APOC1P02654 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
APOC1P02654 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
APOC1P02654 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
APOC1P02654 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
APOC1P02654 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
APOC1P02654 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
APOC1P02654 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
APOC1P02654 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
APOC1P02654 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
APOC1P02654 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
APOC1P02654 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
APOC1P02654 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
APOC1P02654 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
APOC1P02654 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
APOC1P02654 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
APOC1P02654 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
APOC1P02654 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
APOC1P02654 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
APOC1P02654 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
APOC1P02654 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
APOC1P02654 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
APOC1P02654 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
APOC1P02654 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms