Protein–RNA interactions for Protein: P01857

IGHG1, Immunoglobulin heavy constant gamma 1, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGHG1P01857 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
IGHG1P01857 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
IGHG1P01857 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
IGHG1P01857 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
IGHG1P01857 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
IGHG1P01857 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
IGHG1P01857 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
IGHG1P01857 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
IGHG1P01857 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
IGHG1P01857 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
IGHG1P01857 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
IGHG1P01857 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
IGHG1P01857 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
IGHG1P01857 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
IGHG1P01857 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
IGHG1P01857 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
IGHG1P01857 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
IGHG1P01857 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
IGHG1P01857 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
IGHG1P01857 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
IGHG1P01857 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
IGHG1P01857 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
IGHG1P01857 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
IGHG1P01857 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
IGHG1P01857 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
IGHG1P01857 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
IGHG1P01857 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
IGHG1P01857 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
IGHG1P01857 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
IGHG1P01857 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
IGHG1P01857 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
IGHG1P01857 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
IGHG1P01857 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
IGHG1P01857 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
IGHG1P01857 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
IGHG1P01857 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
IGHG1P01857 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
IGHG1P01857 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
IGHG1P01857 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
IGHG1P01857 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
IGHG1P01857 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
IGHG1P01857 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
IGHG1P01857 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
IGHG1P01857 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
IGHG1P01857 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
IGHG1P01857 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
IGHG1P01857 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
IGHG1P01857 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
IGHG1P01857 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
IGHG1P01857 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
IGHG1P01857 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
IGHG1P01857 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
IGHG1P01857 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
IGHG1P01857 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
IGHG1P01857 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
IGHG1P01857 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
IGHG1P01857 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
IGHG1P01857 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
IGHG1P01857 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
IGHG1P01857 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
IGHG1P01857 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
IGHG1P01857 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
IGHG1P01857 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
IGHG1P01857 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
IGHG1P01857 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
IGHG1P01857 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
IGHG1P01857 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
IGHG1P01857 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
IGHG1P01857 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
IGHG1P01857 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
IGHG1P01857 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
IGHG1P01857 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
IGHG1P01857 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
IGHG1P01857 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
IGHG1P01857 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
IGHG1P01857 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
IGHG1P01857 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
IGHG1P01857 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
IGHG1P01857 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
IGHG1P01857 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
IGHG1P01857 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
IGHG1P01857 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
IGHG1P01857 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
IGHG1P01857 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
IGHG1P01857 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
IGHG1P01857 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
IGHG1P01857 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
IGHG1P01857 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
IGHG1P01857 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
IGHG1P01857 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
IGHG1P01857 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
IGHG1P01857 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
IGHG1P01857 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
IGHG1P01857 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
IGHG1P01857 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
IGHG1P01857 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
IGHG1P01857 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
IGHG1P01857 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
IGHG1P01857 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
IGHG1P01857 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms