Protein–RNA interactions for Protein: P01568

IFNA21, Interferon alpha-21, humanhuman

Predictions only

Length 189 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFNA21P01568 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
IFNA21P01568 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
IFNA21P01568 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
IFNA21P01568 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
IFNA21P01568 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
IFNA21P01568 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
IFNA21P01568 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
IFNA21P01568 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
IFNA21P01568 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
IFNA21P01568 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
IFNA21P01568 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
IFNA21P01568 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
IFNA21P01568 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
IFNA21P01568 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
IFNA21P01568 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
IFNA21P01568 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.83
IFNA21P01568 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
IFNA21P01568 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
IFNA21P01568 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
IFNA21P01568 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
IFNA21P01568 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
IFNA21P01568 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
IFNA21P01568 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
IFNA21P01568 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
IFNA21P01568 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
IFNA21P01568 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
IFNA21P01568 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
IFNA21P01568 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
IFNA21P01568 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
IFNA21P01568 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
IFNA21P01568 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
IFNA21P01568 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
IFNA21P01568 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
IFNA21P01568 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
IFNA21P01568 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
IFNA21P01568 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
IFNA21P01568 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
IFNA21P01568 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
IFNA21P01568 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
IFNA21P01568 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
IFNA21P01568 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
IFNA21P01568 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
IFNA21P01568 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
IFNA21P01568 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
IFNA21P01568 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
IFNA21P01568 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
IFNA21P01568 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
IFNA21P01568 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
IFNA21P01568 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
IFNA21P01568 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
IFNA21P01568 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
IFNA21P01568 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
IFNA21P01568 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
IFNA21P01568 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
IFNA21P01568 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
IFNA21P01568 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
IFNA21P01568 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
IFNA21P01568 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
IFNA21P01568 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
IFNA21P01568 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
IFNA21P01568 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
IFNA21P01568 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
IFNA21P01568 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
IFNA21P01568 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
IFNA21P01568 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
IFNA21P01568 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
IFNA21P01568 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
IFNA21P01568 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
IFNA21P01568 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
IFNA21P01568 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
IFNA21P01568 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
IFNA21P01568 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
IFNA21P01568 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
IFNA21P01568 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
IFNA21P01568 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
IFNA21P01568 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
IFNA21P01568 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
IFNA21P01568 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
IFNA21P01568 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
IFNA21P01568 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
IFNA21P01568 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
IFNA21P01568 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
IFNA21P01568 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
IFNA21P01568 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
IFNA21P01568 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
IFNA21P01568 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
IFNA21P01568 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
IFNA21P01568 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
IFNA21P01568 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
IFNA21P01568 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
IFNA21P01568 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
IFNA21P01568 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
IFNA21P01568 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
IFNA21P01568 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
IFNA21P01568 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
IFNA21P01568 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
IFNA21P01568 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
IFNA21P01568 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
IFNA21P01568 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
IFNA21P01568 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms