Protein–RNA interactions for Protein: O95484

CLDN9, Claudin-9, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN9O95484 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CLDN9O95484 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CLDN9O95484 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CLDN9O95484 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CLDN9O95484 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CLDN9O95484 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CLDN9O95484 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CLDN9O95484 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CLDN9O95484 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CLDN9O95484 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CLDN9O95484 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CLDN9O95484 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CLDN9O95484 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CLDN9O95484 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CLDN9O95484 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CLDN9O95484 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CLDN9O95484 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CLDN9O95484 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CLDN9O95484 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CLDN9O95484 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CLDN9O95484 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CLDN9O95484 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
CLDN9O95484 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CLDN9O95484 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CLDN9O95484 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CLDN9O95484 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CLDN9O95484 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CLDN9O95484 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
CLDN9O95484 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CLDN9O95484 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CLDN9O95484 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
CLDN9O95484 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CLDN9O95484 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CLDN9O95484 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
CLDN9O95484 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CLDN9O95484 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CLDN9O95484 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CLDN9O95484 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CLDN9O95484 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CLDN9O95484 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CLDN9O95484 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CLDN9O95484 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CLDN9O95484 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CLDN9O95484 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CLDN9O95484 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CLDN9O95484 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CLDN9O95484 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CLDN9O95484 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CLDN9O95484 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CLDN9O95484 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CLDN9O95484 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
CLDN9O95484 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
CLDN9O95484 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CLDN9O95484 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CLDN9O95484 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CLDN9O95484 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CLDN9O95484 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CLDN9O95484 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CLDN9O95484 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CLDN9O95484 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CLDN9O95484 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CLDN9O95484 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
CLDN9O95484 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CLDN9O95484 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CLDN9O95484 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CLDN9O95484 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CLDN9O95484 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CLDN9O95484 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CLDN9O95484 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CLDN9O95484 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CLDN9O95484 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CLDN9O95484 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CLDN9O95484 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CLDN9O95484 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CLDN9O95484 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CLDN9O95484 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CLDN9O95484 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
CLDN9O95484 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CLDN9O95484 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CLDN9O95484 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CLDN9O95484 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
CLDN9O95484 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CLDN9O95484 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CLDN9O95484 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CLDN9O95484 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CLDN9O95484 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CLDN9O95484 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CLDN9O95484 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CLDN9O95484 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CLDN9O95484 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CLDN9O95484 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CLDN9O95484 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CLDN9O95484 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CLDN9O95484 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CLDN9O95484 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CLDN9O95484 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CLDN9O95484 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CLDN9O95484 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CLDN9O95484 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CLDN9O95484 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms