Protein–RNA interactions for Protein: O95171

SCEL, Sciellin, humanhuman

Predictions only

Length 688 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCELO95171 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SCELO95171 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SCELO95171 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SCELO95171 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SCELO95171 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SCELO95171 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
SCELO95171 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SCELO95171 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SCELO95171 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
SCELO95171 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SCELO95171 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SCELO95171 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SCELO95171 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SCELO95171 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SCELO95171 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SCELO95171 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SCELO95171 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SCELO95171 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SCELO95171 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SCELO95171 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SCELO95171 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SCELO95171 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
SCELO95171 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SCELO95171 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SCELO95171 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SCELO95171 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SCELO95171 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SCELO95171 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SCELO95171 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SCELO95171 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SCELO95171 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SCELO95171 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SCELO95171 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SCELO95171 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SCELO95171 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SCELO95171 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SCELO95171 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SCELO95171 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SCELO95171 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SCELO95171 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SCELO95171 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SCELO95171 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SCELO95171 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SCELO95171 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SCELO95171 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SCELO95171 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SCELO95171 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SCELO95171 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SCELO95171 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SCELO95171 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SCELO95171 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SCELO95171 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SCELO95171 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SCELO95171 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SCELO95171 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SCELO95171 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SCELO95171 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SCELO95171 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SCELO95171 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SCELO95171 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SCELO95171 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SCELO95171 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SCELO95171 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SCELO95171 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SCELO95171 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SCELO95171 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SCELO95171 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SCELO95171 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SCELO95171 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SCELO95171 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SCELO95171 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SCELO95171 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SCELO95171 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SCELO95171 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SCELO95171 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SCELO95171 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SCELO95171 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SCELO95171 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
SCELO95171 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SCELO95171 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SCELO95171 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
SCELO95171 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
SCELO95171 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
SCELO95171 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SCELO95171 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SCELO95171 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SCELO95171 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SCELO95171 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SCELO95171 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SCELO95171 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SCELO95171 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SCELO95171 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SCELO95171 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SCELO95171 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SCELO95171 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
SCELO95171 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SCELO95171 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SCELO95171 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SCELO95171 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SCELO95171 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.2 ms