Protein–RNA interactions for Protein: O94817

ATG12, Ubiquitin-like protein ATG12, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG12O94817 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ATG12O94817 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ATG12O94817 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ATG12O94817 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
ATG12O94817 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ATG12O94817 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ATG12O94817 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ATG12O94817 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ATG12O94817 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
ATG12O94817 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
ATG12O94817 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ATG12O94817 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ATG12O94817 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ATG12O94817 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ATG12O94817 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ATG12O94817 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ATG12O94817 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ATG12O94817 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ATG12O94817 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ATG12O94817 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ATG12O94817 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ATG12O94817 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ATG12O94817 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ATG12O94817 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
ATG12O94817 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
ATG12O94817 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ATG12O94817 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ATG12O94817 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ATG12O94817 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ATG12O94817 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ATG12O94817 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ATG12O94817 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ATG12O94817 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ATG12O94817 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ATG12O94817 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ATG12O94817 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ATG12O94817 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ATG12O94817 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ATG12O94817 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ATG12O94817 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ATG12O94817 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ATG12O94817 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ATG12O94817 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ATG12O94817 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ATG12O94817 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ATG12O94817 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ATG12O94817 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ATG12O94817 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ATG12O94817 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ATG12O94817 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ATG12O94817 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ATG12O94817 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ATG12O94817 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ATG12O94817 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ATG12O94817 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ATG12O94817 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
ATG12O94817 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ATG12O94817 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ATG12O94817 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ATG12O94817 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ATG12O94817 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ATG12O94817 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ATG12O94817 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ATG12O94817 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ATG12O94817 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ATG12O94817 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ATG12O94817 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ATG12O94817 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ATG12O94817 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ATG12O94817 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ATG12O94817 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ATG12O94817 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ATG12O94817 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ATG12O94817 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ATG12O94817 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ATG12O94817 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ATG12O94817 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ATG12O94817 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ATG12O94817 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ATG12O94817 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ATG12O94817 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ATG12O94817 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ATG12O94817 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ATG12O94817 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ATG12O94817 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ATG12O94817 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ATG12O94817 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ATG12O94817 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ATG12O94817 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
ATG12O94817 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ATG12O94817 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ATG12O94817 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ATG12O94817 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ATG12O94817 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ATG12O94817 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ATG12O94817 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ATG12O94817 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ATG12O94817 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ATG12O94817 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ATG12O94817 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms