Protein–RNA interactions for Protein: O94788

ALDH1A2, Retinal dehydrogenase 2, humanhuman

Predictions only

Length 518 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALDH1A2O94788 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ALDH1A2O94788 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ALDH1A2O94788 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ALDH1A2O94788 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ALDH1A2O94788 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ALDH1A2O94788 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ALDH1A2O94788 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ALDH1A2O94788 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ALDH1A2O94788 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ALDH1A2O94788 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ALDH1A2O94788 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ALDH1A2O94788 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ALDH1A2O94788 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ALDH1A2O94788 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ALDH1A2O94788 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ALDH1A2O94788 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ALDH1A2O94788 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ALDH1A2O94788 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ALDH1A2O94788 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
ALDH1A2O94788 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC25.45■■□□□ 1.66
ALDH1A2O94788 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ALDH1A2O94788 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
ALDH1A2O94788 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ALDH1A2O94788 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ALDH1A2O94788 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ALDH1A2O94788 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ALDH1A2O94788 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ALDH1A2O94788 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ALDH1A2O94788 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ALDH1A2O94788 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ALDH1A2O94788 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ALDH1A2O94788 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ALDH1A2O94788 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ALDH1A2O94788 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ALDH1A2O94788 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ALDH1A2O94788 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ALDH1A2O94788 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ALDH1A2O94788 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ALDH1A2O94788 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ALDH1A2O94788 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ALDH1A2O94788 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ALDH1A2O94788 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ALDH1A2O94788 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ALDH1A2O94788 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ALDH1A2O94788 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ALDH1A2O94788 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ALDH1A2O94788 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ALDH1A2O94788 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ALDH1A2O94788 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
ALDH1A2O94788 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ALDH1A2O94788 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ALDH1A2O94788 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
ALDH1A2O94788 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ALDH1A2O94788 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
ALDH1A2O94788 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
ALDH1A2O94788 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
ALDH1A2O94788 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
ALDH1A2O94788 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ALDH1A2O94788 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ALDH1A2O94788 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ALDH1A2O94788 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ALDH1A2O94788 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ALDH1A2O94788 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ALDH1A2O94788 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ALDH1A2O94788 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ALDH1A2O94788 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ALDH1A2O94788 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ALDH1A2O94788 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ALDH1A2O94788 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ALDH1A2O94788 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ALDH1A2O94788 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ALDH1A2O94788 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ALDH1A2O94788 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ALDH1A2O94788 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ALDH1A2O94788 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
ALDH1A2O94788 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ALDH1A2O94788 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
ALDH1A2O94788 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ALDH1A2O94788 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ALDH1A2O94788 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ALDH1A2O94788 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ALDH1A2O94788 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ALDH1A2O94788 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ALDH1A2O94788 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ALDH1A2O94788 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
ALDH1A2O94788 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ALDH1A2O94788 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
ALDH1A2O94788 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ALDH1A2O94788 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ALDH1A2O94788 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ALDH1A2O94788 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
ALDH1A2O94788 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ALDH1A2O94788 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ALDH1A2O94788 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ALDH1A2O94788 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ALDH1A2O94788 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ALDH1A2O94788 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ALDH1A2O94788 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ALDH1A2O94788 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ALDH1A2O94788 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 174.6 ms