Protein–RNA interactions for Protein: O75569

PRKRA, Interferon-inducible double-stranded RNA-dependent protein kinase activator A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 313 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKRAO75569 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PRKRAO75569 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PRKRAO75569 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PRKRAO75569 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PRKRAO75569 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PRKRAO75569 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PRKRAO75569 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PRKRAO75569 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PRKRAO75569 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PRKRAO75569 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PRKRAO75569 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PRKRAO75569 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PRKRAO75569 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PRKRAO75569 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PRKRAO75569 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PRKRAO75569 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PRKRAO75569 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PRKRAO75569 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
PRKRAO75569 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PRKRAO75569 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PRKRAO75569 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PRKRAO75569 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PRKRAO75569 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PRKRAO75569 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PRKRAO75569 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PRKRAO75569 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PRKRAO75569 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PRKRAO75569 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
PRKRAO75569 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
PRKRAO75569 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PRKRAO75569 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PRKRAO75569 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PRKRAO75569 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PRKRAO75569 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PRKRAO75569 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PRKRAO75569 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PRKRAO75569 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
PRKRAO75569 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PRKRAO75569 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PRKRAO75569 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PRKRAO75569 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PRKRAO75569 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PRKRAO75569 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
PRKRAO75569 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PRKRAO75569 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PRKRAO75569 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PRKRAO75569 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PRKRAO75569 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PRKRAO75569 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PRKRAO75569 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PRKRAO75569 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PRKRAO75569 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PRKRAO75569 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PRKRAO75569 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PRKRAO75569 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PRKRAO75569 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PRKRAO75569 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PRKRAO75569 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PRKRAO75569 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PRKRAO75569 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PRKRAO75569 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PRKRAO75569 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PRKRAO75569 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PRKRAO75569 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PRKRAO75569 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PRKRAO75569 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PRKRAO75569 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PRKRAO75569 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
PRKRAO75569 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PRKRAO75569 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PRKRAO75569 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PRKRAO75569 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PRKRAO75569 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PRKRAO75569 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PRKRAO75569 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PRKRAO75569 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PRKRAO75569 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
PRKRAO75569 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PRKRAO75569 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PRKRAO75569 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PRKRAO75569 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PRKRAO75569 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
PRKRAO75569 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PRKRAO75569 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PRKRAO75569 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PRKRAO75569 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
PRKRAO75569 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PRKRAO75569 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PRKRAO75569 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PRKRAO75569 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PRKRAO75569 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PRKRAO75569 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PRKRAO75569 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PRKRAO75569 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PRKRAO75569 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PRKRAO75569 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PRKRAO75569 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PRKRAO75569 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PRKRAO75569 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PRKRAO75569 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.6 ms