Protein–RNA interactions for Protein: O75298

RTN2, Reticulon-2, humanhuman

Predictions only

Length 545 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTN2O75298 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
RTN2O75298 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
RTN2O75298 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
RTN2O75298 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
RTN2O75298 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
RTN2O75298 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
RTN2O75298 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
RTN2O75298 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
RTN2O75298 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
RTN2O75298 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
RTN2O75298 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
RTN2O75298 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
RTN2O75298 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
RTN2O75298 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
RTN2O75298 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
RTN2O75298 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
RTN2O75298 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
RTN2O75298 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
RTN2O75298 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
RTN2O75298 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
RTN2O75298 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
RTN2O75298 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
RTN2O75298 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
RTN2O75298 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
RTN2O75298 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
RTN2O75298 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
RTN2O75298 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
RTN2O75298 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
RTN2O75298 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
RTN2O75298 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
RTN2O75298 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
RTN2O75298 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
RTN2O75298 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
RTN2O75298 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
RTN2O75298 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
RTN2O75298 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
RTN2O75298 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
RTN2O75298 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
RTN2O75298 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
RTN2O75298 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
RTN2O75298 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
RTN2O75298 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
RTN2O75298 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
RTN2O75298 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
RTN2O75298 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
RTN2O75298 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
RTN2O75298 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
RTN2O75298 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
RTN2O75298 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
RTN2O75298 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
RTN2O75298 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
RTN2O75298 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
RTN2O75298 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
RTN2O75298 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
RTN2O75298 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
RTN2O75298 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
RTN2O75298 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
RTN2O75298 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
RTN2O75298 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
RTN2O75298 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
RTN2O75298 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
RTN2O75298 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
RTN2O75298 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
RTN2O75298 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
RTN2O75298 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
RTN2O75298 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
RTN2O75298 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
RTN2O75298 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
RTN2O75298 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
RTN2O75298 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
RTN2O75298 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
RTN2O75298 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
RTN2O75298 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
RTN2O75298 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
RTN2O75298 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
RTN2O75298 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
RTN2O75298 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
RTN2O75298 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
RTN2O75298 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
RTN2O75298 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
RTN2O75298 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
RTN2O75298 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
RTN2O75298 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
RTN2O75298 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
RTN2O75298 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
RTN2O75298 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
RTN2O75298 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
RTN2O75298 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
RTN2O75298 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
RTN2O75298 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
RTN2O75298 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
RTN2O75298 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
RTN2O75298 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
RTN2O75298 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
RTN2O75298 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
RTN2O75298 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
RTN2O75298 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
RTN2O75298 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
RTN2O75298 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
RTN2O75298 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 100.4 ms