Protein–RNA interactions for Protein: O75145

PPFIA3, Liprin-alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPFIA3O75145 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
PPFIA3O75145 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
PPFIA3O75145 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
PPFIA3O75145 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
PPFIA3O75145 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
PPFIA3O75145 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
PPFIA3O75145 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
PPFIA3O75145 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
PPFIA3O75145 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
PPFIA3O75145 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
PPFIA3O75145 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.19
PPFIA3O75145 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.19
PPFIA3O75145 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.7■■■□□ 2.18
PPFIA3O75145 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
PPFIA3O75145 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
PPFIA3O75145 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
PPFIA3O75145 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
PPFIA3O75145 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC28.68■■■□□ 2.18
PPFIA3O75145 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
PPFIA3O75145 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
PPFIA3O75145 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
PPFIA3O75145 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
PPFIA3O75145 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
PPFIA3O75145 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
PPFIA3O75145 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
PPFIA3O75145 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
PPFIA3O75145 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
PPFIA3O75145 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
PPFIA3O75145 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
PPFIA3O75145 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
PPFIA3O75145 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
PPFIA3O75145 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
PPFIA3O75145 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
PPFIA3O75145 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
PPFIA3O75145 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
PPFIA3O75145 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
PPFIA3O75145 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
PPFIA3O75145 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
PPFIA3O75145 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
PPFIA3O75145 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
PPFIA3O75145 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
PPFIA3O75145 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC28.62■■■□□ 2.17
PPFIA3O75145 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
PPFIA3O75145 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
PPFIA3O75145 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
PPFIA3O75145 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
PPFIA3O75145 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
PPFIA3O75145 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
PPFIA3O75145 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
PPFIA3O75145 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
PPFIA3O75145 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
PPFIA3O75145 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
PPFIA3O75145 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
PPFIA3O75145 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
PPFIA3O75145 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
PPFIA3O75145 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
PPFIA3O75145 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
PPFIA3O75145 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
PPFIA3O75145 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
PPFIA3O75145 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
PPFIA3O75145 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
PPFIA3O75145 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
PPFIA3O75145 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
PPFIA3O75145 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
PPFIA3O75145 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
PPFIA3O75145 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.16
PPFIA3O75145 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
PPFIA3O75145 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
PPFIA3O75145 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
PPFIA3O75145 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
PPFIA3O75145 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
PPFIA3O75145 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
PPFIA3O75145 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
PPFIA3O75145 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
PPFIA3O75145 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
PPFIA3O75145 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
PPFIA3O75145 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
PPFIA3O75145 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
PPFIA3O75145 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
PPFIA3O75145 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
PPFIA3O75145 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
PPFIA3O75145 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
PPFIA3O75145 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
PPFIA3O75145 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
PPFIA3O75145 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
PPFIA3O75145 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
PPFIA3O75145 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
PPFIA3O75145 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
PPFIA3O75145 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
PPFIA3O75145 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
PPFIA3O75145 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
PPFIA3O75145 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
PPFIA3O75145 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
PPFIA3O75145 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
PPFIA3O75145 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.16
PPFIA3O75145 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
PPFIA3O75145 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC28.51■■■□□ 2.15
PPFIA3O75145 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
PPFIA3O75145 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
PPFIA3O75145 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51 ms