Protein–RNA interactions for Protein: O60882

MMP20, Matrix metalloproteinase-20, humanhuman

Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MMP20O60882 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
MMP20O60882 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
MMP20O60882 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
MMP20O60882 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
MMP20O60882 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
MMP20O60882 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
MMP20O60882 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
MMP20O60882 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
MMP20O60882 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
MMP20O60882 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
MMP20O60882 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
MMP20O60882 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC24.57■■□□□ 1.52
MMP20O60882 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
MMP20O60882 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
MMP20O60882 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
MMP20O60882 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
MMP20O60882 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
MMP20O60882 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
MMP20O60882 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
MMP20O60882 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
MMP20O60882 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
MMP20O60882 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
MMP20O60882 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
MMP20O60882 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
MMP20O60882 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
MMP20O60882 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
MMP20O60882 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
MMP20O60882 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
MMP20O60882 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
MMP20O60882 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
MMP20O60882 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
MMP20O60882 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
MMP20O60882 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
MMP20O60882 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
MMP20O60882 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
MMP20O60882 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
MMP20O60882 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
MMP20O60882 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
MMP20O60882 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
MMP20O60882 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
MMP20O60882 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
MMP20O60882 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24.49■■□□□ 1.51
MMP20O60882 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
MMP20O60882 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
MMP20O60882 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
MMP20O60882 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
MMP20O60882 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
MMP20O60882 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
MMP20O60882 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
MMP20O60882 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
MMP20O60882 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
MMP20O60882 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC24.47■■□□□ 1.51
MMP20O60882 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
MMP20O60882 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
MMP20O60882 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
MMP20O60882 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
MMP20O60882 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
MMP20O60882 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
MMP20O60882 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
MMP20O60882 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
MMP20O60882 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
MMP20O60882 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
MMP20O60882 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
MMP20O60882 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
MMP20O60882 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
MMP20O60882 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
MMP20O60882 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
MMP20O60882 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
MMP20O60882 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
MMP20O60882 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
MMP20O60882 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
MMP20O60882 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
MMP20O60882 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
MMP20O60882 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
MMP20O60882 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MMP20O60882 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
MMP20O60882 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
MMP20O60882 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
MMP20O60882 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
MMP20O60882 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
MMP20O60882 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
MMP20O60882 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
MMP20O60882 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
MMP20O60882 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MMP20O60882 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MMP20O60882 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
MMP20O60882 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
MMP20O60882 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
MMP20O60882 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MMP20O60882 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
MMP20O60882 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
MMP20O60882 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
MMP20O60882 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
MMP20O60882 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
MMP20O60882 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
MMP20O60882 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
MMP20O60882 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
MMP20O60882 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
MMP20O60882 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
MMP20O60882 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.8 ms