Protein–RNA interactions for Protein: O60637

TSPAN3, Tetraspanin-3, humanhuman

Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN3O60637 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
TSPAN3O60637 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
TSPAN3O60637 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
TSPAN3O60637 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TSPAN3O60637 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TSPAN3O60637 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
TSPAN3O60637 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TSPAN3O60637 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TSPAN3O60637 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TSPAN3O60637 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TSPAN3O60637 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TSPAN3O60637 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TSPAN3O60637 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TSPAN3O60637 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TSPAN3O60637 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TSPAN3O60637 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TSPAN3O60637 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TSPAN3O60637 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TSPAN3O60637 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TSPAN3O60637 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
TSPAN3O60637 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TSPAN3O60637 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TSPAN3O60637 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TSPAN3O60637 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TSPAN3O60637 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
TSPAN3O60637 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
TSPAN3O60637 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TSPAN3O60637 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TSPAN3O60637 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TSPAN3O60637 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TSPAN3O60637 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TSPAN3O60637 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TSPAN3O60637 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TSPAN3O60637 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TSPAN3O60637 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TSPAN3O60637 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TSPAN3O60637 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TSPAN3O60637 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TSPAN3O60637 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TSPAN3O60637 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TSPAN3O60637 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TSPAN3O60637 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TSPAN3O60637 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TSPAN3O60637 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TSPAN3O60637 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TSPAN3O60637 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TSPAN3O60637 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
TSPAN3O60637 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
TSPAN3O60637 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TSPAN3O60637 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TSPAN3O60637 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TSPAN3O60637 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TSPAN3O60637 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TSPAN3O60637 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
TSPAN3O60637 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TSPAN3O60637 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TSPAN3O60637 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TSPAN3O60637 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TSPAN3O60637 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TSPAN3O60637 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TSPAN3O60637 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TSPAN3O60637 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
TSPAN3O60637 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TSPAN3O60637 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
TSPAN3O60637 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TSPAN3O60637 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TSPAN3O60637 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TSPAN3O60637 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TSPAN3O60637 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
TSPAN3O60637 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TSPAN3O60637 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TSPAN3O60637 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TSPAN3O60637 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TSPAN3O60637 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TSPAN3O60637 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TSPAN3O60637 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TSPAN3O60637 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TSPAN3O60637 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TSPAN3O60637 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
TSPAN3O60637 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TSPAN3O60637 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TSPAN3O60637 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TSPAN3O60637 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TSPAN3O60637 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TSPAN3O60637 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TSPAN3O60637 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TSPAN3O60637 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TSPAN3O60637 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TSPAN3O60637 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
TSPAN3O60637 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
TSPAN3O60637 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TSPAN3O60637 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TSPAN3O60637 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
TSPAN3O60637 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TSPAN3O60637 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TSPAN3O60637 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TSPAN3O60637 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TSPAN3O60637 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TSPAN3O60637 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TSPAN3O60637 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.1 ms