Protein–RNA interactions for Protein: O43741

PRKAB2, 5'-AMP-activated protein kinase subunit beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKAB2O43741 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
PRKAB2O43741 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
PRKAB2O43741 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
PRKAB2O43741 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
PRKAB2O43741 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
PRKAB2O43741 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
PRKAB2O43741 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC29.42■■■□□ 2.3
PRKAB2O43741 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
PRKAB2O43741 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
PRKAB2O43741 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
PRKAB2O43741 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
PRKAB2O43741 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
PRKAB2O43741 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC29.41■■■□□ 2.3
PRKAB2O43741 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
PRKAB2O43741 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
PRKAB2O43741 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
PRKAB2O43741 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
PRKAB2O43741 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
PRKAB2O43741 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
PRKAB2O43741 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
PRKAB2O43741 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
PRKAB2O43741 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC29.39■■■□□ 2.3
PRKAB2O43741 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
PRKAB2O43741 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
PRKAB2O43741 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
PRKAB2O43741 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
PRKAB2O43741 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
PRKAB2O43741 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
PRKAB2O43741 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
PRKAB2O43741 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
PRKAB2O43741 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
PRKAB2O43741 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
PRKAB2O43741 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
PRKAB2O43741 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
PRKAB2O43741 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
PRKAB2O43741 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
PRKAB2O43741 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
PRKAB2O43741 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
PRKAB2O43741 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
PRKAB2O43741 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
PRKAB2O43741 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
PRKAB2O43741 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
PRKAB2O43741 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
PRKAB2O43741 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
PRKAB2O43741 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
PRKAB2O43741 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
PRKAB2O43741 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC29.34■■■□□ 2.29
PRKAB2O43741 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
PRKAB2O43741 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC29.34■■■□□ 2.29
PRKAB2O43741 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
PRKAB2O43741 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
PRKAB2O43741 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
PRKAB2O43741 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
PRKAB2O43741 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
PRKAB2O43741 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
PRKAB2O43741 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
PRKAB2O43741 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
PRKAB2O43741 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
PRKAB2O43741 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC29.32■■■□□ 2.28
PRKAB2O43741 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC29.32■■■□□ 2.28
PRKAB2O43741 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
PRKAB2O43741 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
PRKAB2O43741 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC29.31■■■□□ 2.28
PRKAB2O43741 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
PRKAB2O43741 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
PRKAB2O43741 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
PRKAB2O43741 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC29.3■■■□□ 2.28
PRKAB2O43741 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
PRKAB2O43741 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
PRKAB2O43741 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
PRKAB2O43741 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
PRKAB2O43741 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
PRKAB2O43741 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
PRKAB2O43741 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
PRKAB2O43741 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
PRKAB2O43741 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
PRKAB2O43741 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
PRKAB2O43741 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
PRKAB2O43741 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
PRKAB2O43741 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
PRKAB2O43741 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
PRKAB2O43741 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
PRKAB2O43741 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
PRKAB2O43741 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
PRKAB2O43741 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
PRKAB2O43741 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC29.25■■■□□ 2.27
PRKAB2O43741 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC29.25■■■□□ 2.27
PRKAB2O43741 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
PRKAB2O43741 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC29.25■■■□□ 2.27
PRKAB2O43741 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
PRKAB2O43741 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
PRKAB2O43741 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
PRKAB2O43741 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
PRKAB2O43741 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
PRKAB2O43741 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC29.23■■■□□ 2.27
PRKAB2O43741 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
PRKAB2O43741 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
PRKAB2O43741 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
PRKAB2O43741 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
PRKAB2O43741 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms