Protein–RNA interactions for Protein: O43310

CTIF, CBP80/20-dependent translation initiation factor, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 598 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTIFO43310 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CTIFO43310 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CTIFO43310 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CTIFO43310 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CTIFO43310 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CTIFO43310 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CTIFO43310 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CTIFO43310 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CTIFO43310 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CTIFO43310 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CTIFO43310 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CTIFO43310 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CTIFO43310 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
CTIFO43310 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
CTIFO43310 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
CTIFO43310 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
CTIFO43310 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
CTIFO43310 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CTIFO43310 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CTIFO43310 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CTIFO43310 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CTIFO43310 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CTIFO43310 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CTIFO43310 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CTIFO43310 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CTIFO43310 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CTIFO43310 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CTIFO43310 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CTIFO43310 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CTIFO43310 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CTIFO43310 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CTIFO43310 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CTIFO43310 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CTIFO43310 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CTIFO43310 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CTIFO43310 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
CTIFO43310 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CTIFO43310 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CTIFO43310 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CTIFO43310 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CTIFO43310 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CTIFO43310 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CTIFO43310 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
CTIFO43310 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CTIFO43310 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CTIFO43310 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CTIFO43310 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CTIFO43310 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CTIFO43310 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CTIFO43310 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CTIFO43310 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CTIFO43310 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CTIFO43310 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CTIFO43310 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CTIFO43310 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CTIFO43310 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CTIFO43310 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
CTIFO43310 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CTIFO43310 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CTIFO43310 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CTIFO43310 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CTIFO43310 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CTIFO43310 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CTIFO43310 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CTIFO43310 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CTIFO43310 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CTIFO43310 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CTIFO43310 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CTIFO43310 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CTIFO43310 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CTIFO43310 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CTIFO43310 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CTIFO43310 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CTIFO43310 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC26■■□□□ 1.75
CTIFO43310 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
CTIFO43310 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CTIFO43310 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CTIFO43310 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CTIFO43310 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CTIFO43310 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CTIFO43310 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CTIFO43310 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CTIFO43310 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CTIFO43310 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CTIFO43310 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
CTIFO43310 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CTIFO43310 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CTIFO43310 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CTIFO43310 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CTIFO43310 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CTIFO43310 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CTIFO43310 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CTIFO43310 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CTIFO43310 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CTIFO43310 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CTIFO43310 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CTIFO43310 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CTIFO43310 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CTIFO43310 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CTIFO43310 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
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