Protein–RNA interactions for Protein: O15360

FANCA, Fanconi anemia group A protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCAO15360 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.07■■■■□ 3.68
FANCAO15360 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC38.07■■■■□ 3.68
FANCAO15360 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC38.07■■■■□ 3.68
FANCAO15360 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.07■■■■□ 3.68
FANCAO15360 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC38.07■■■■□ 3.68
FANCAO15360 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.06■■■■□ 3.68
FANCAO15360 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.06■■■■□ 3.68
FANCAO15360 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC38.06■■■■□ 3.68
FANCAO15360 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC38.06■■■■□ 3.68
FANCAO15360 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.05■■■■□ 3.68
FANCAO15360 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC38.04■■■■□ 3.68
FANCAO15360 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.04■■■■□ 3.68
FANCAO15360 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC38.03■■■■□ 3.68
FANCAO15360 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.03■■■■□ 3.68
FANCAO15360 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.03■■■■□ 3.68
FANCAO15360 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.03■■■■□ 3.68
FANCAO15360 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC38.03■■■■□ 3.68
FANCAO15360 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC38.03■■■■□ 3.68
FANCAO15360 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.03■■■■□ 3.68
FANCAO15360 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.02■■■■□ 3.68
FANCAO15360 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC38.02■■■■□ 3.68
FANCAO15360 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC38.02■■■■□ 3.68
FANCAO15360 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC38.02■■■■□ 3.68
FANCAO15360 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC38.01■■■■□ 3.67
FANCAO15360 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.01■■■■□ 3.67
FANCAO15360 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC38■■■■□ 3.67
FANCAO15360 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.99■■■■□ 3.67
FANCAO15360 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC37.99■■■■□ 3.67
FANCAO15360 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.98■■■■□ 3.67
FANCAO15360 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.98■■■■□ 3.67
FANCAO15360 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.97■■■■□ 3.67
FANCAO15360 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.97■■■■□ 3.67
FANCAO15360 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC37.96■■■■□ 3.67
FANCAO15360 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.96■■■■□ 3.67
FANCAO15360 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.96■■■■□ 3.67
FANCAO15360 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.96■■■■□ 3.67
FANCAO15360 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC37.96■■■■□ 3.67
FANCAO15360 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.95■■■■□ 3.67
FANCAO15360 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC37.95■■■■□ 3.67
FANCAO15360 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC37.94■■■■□ 3.66
FANCAO15360 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.94■■■■□ 3.66
FANCAO15360 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.93■■■■□ 3.66
FANCAO15360 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC37.92■■■■□ 3.66
FANCAO15360 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC37.92■■■■□ 3.66
FANCAO15360 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.92■■■■□ 3.66
FANCAO15360 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC37.92■■■■□ 3.66
FANCAO15360 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.92■■■■□ 3.66
FANCAO15360 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC37.91■■■■□ 3.66
FANCAO15360 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC37.91■■■■□ 3.66
FANCAO15360 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC37.91■■■■□ 3.66
FANCAO15360 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC37.91■■■■□ 3.66
FANCAO15360 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.9■■■■□ 3.66
FANCAO15360 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.9■■■■□ 3.66
FANCAO15360 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.89■■■■□ 3.66
FANCAO15360 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC37.89■■■■□ 3.66
FANCAO15360 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.89■■■■□ 3.66
FANCAO15360 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.88■■■■□ 3.65
FANCAO15360 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.88■■■■□ 3.65
FANCAO15360 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC37.88■■■■□ 3.65
FANCAO15360 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC37.88■■■■□ 3.65
FANCAO15360 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.87■■■■□ 3.65
FANCAO15360 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.87■■■■□ 3.65
FANCAO15360 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC37.87■■■■□ 3.65
FANCAO15360 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC37.86■■■■□ 3.65
FANCAO15360 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC37.86■■■■□ 3.65
FANCAO15360 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.85■■■■□ 3.65
FANCAO15360 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC37.85■■■■□ 3.65
FANCAO15360 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.84■■■■□ 3.65
FANCAO15360 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC37.84■■■■□ 3.65
FANCAO15360 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC37.84■■■■□ 3.65
FANCAO15360 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC37.84■■■■□ 3.65
FANCAO15360 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC37.84■■■■□ 3.65
FANCAO15360 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC37.84■■■■□ 3.65
FANCAO15360 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.84■■■■□ 3.65
FANCAO15360 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.83■■■■□ 3.65
FANCAO15360 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.81■■■■□ 3.64
FANCAO15360 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.8■■■■□ 3.64
FANCAO15360 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC37.78■■■■□ 3.64
FANCAO15360 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.77■■■■□ 3.64
FANCAO15360 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC37.77■■■■□ 3.64
FANCAO15360 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.77■■■■□ 3.64
FANCAO15360 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.77■■■■□ 3.64
FANCAO15360 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.76■■■■□ 3.63
FANCAO15360 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.75■■■■□ 3.63
FANCAO15360 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC37.75■■■■□ 3.63
FANCAO15360 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC37.74■■■■□ 3.63
FANCAO15360 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC37.74■■■■□ 3.63
FANCAO15360 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.73■■■■□ 3.63
FANCAO15360 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC37.73■■■■□ 3.63
FANCAO15360 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC37.73■■■■□ 3.63
FANCAO15360 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC37.73■■■■□ 3.63
FANCAO15360 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.73■■■■□ 3.63
FANCAO15360 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC37.73■■■■□ 3.63
FANCAO15360 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC37.73■■■■□ 3.63
FANCAO15360 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC37.72■■■■□ 3.63
FANCAO15360 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC37.72■■■■□ 3.63
FANCAO15360 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC37.72■■■■□ 3.63
FANCAO15360 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC37.72■■■■□ 3.63
FANCAO15360 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC37.71■■■■□ 3.63
FANCAO15360 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.71■■■■□ 3.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.3 ms