Protein–RNA interactions for Protein: O15126

SCAMP1, Secretory carrier-associated membrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAMP1O15126 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
SCAMP1O15126 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SCAMP1O15126 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SCAMP1O15126 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SCAMP1O15126 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SCAMP1O15126 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SCAMP1O15126 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SCAMP1O15126 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SCAMP1O15126 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SCAMP1O15126 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
SCAMP1O15126 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SCAMP1O15126 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
SCAMP1O15126 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SCAMP1O15126 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SCAMP1O15126 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SCAMP1O15126 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SCAMP1O15126 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SCAMP1O15126 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SCAMP1O15126 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SCAMP1O15126 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SCAMP1O15126 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SCAMP1O15126 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SCAMP1O15126 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SCAMP1O15126 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SCAMP1O15126 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SCAMP1O15126 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SCAMP1O15126 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SCAMP1O15126 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SCAMP1O15126 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SCAMP1O15126 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SCAMP1O15126 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SCAMP1O15126 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SCAMP1O15126 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SCAMP1O15126 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SCAMP1O15126 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SCAMP1O15126 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SCAMP1O15126 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SCAMP1O15126 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
SCAMP1O15126 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SCAMP1O15126 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SCAMP1O15126 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SCAMP1O15126 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SCAMP1O15126 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
SCAMP1O15126 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
SCAMP1O15126 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SCAMP1O15126 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SCAMP1O15126 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SCAMP1O15126 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SCAMP1O15126 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SCAMP1O15126 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SCAMP1O15126 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SCAMP1O15126 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SCAMP1O15126 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SCAMP1O15126 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SCAMP1O15126 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SCAMP1O15126 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SCAMP1O15126 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SCAMP1O15126 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SCAMP1O15126 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
SCAMP1O15126 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SCAMP1O15126 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SCAMP1O15126 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
SCAMP1O15126 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SCAMP1O15126 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SCAMP1O15126 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SCAMP1O15126 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SCAMP1O15126 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SCAMP1O15126 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SCAMP1O15126 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SCAMP1O15126 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SCAMP1O15126 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
SCAMP1O15126 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SCAMP1O15126 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SCAMP1O15126 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SCAMP1O15126 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SCAMP1O15126 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
SCAMP1O15126 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SCAMP1O15126 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SCAMP1O15126 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SCAMP1O15126 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SCAMP1O15126 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SCAMP1O15126 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SCAMP1O15126 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SCAMP1O15126 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SCAMP1O15126 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SCAMP1O15126 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SCAMP1O15126 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SCAMP1O15126 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SCAMP1O15126 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SCAMP1O15126 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SCAMP1O15126 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SCAMP1O15126 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SCAMP1O15126 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SCAMP1O15126 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SCAMP1O15126 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SCAMP1O15126 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SCAMP1O15126 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SCAMP1O15126 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SCAMP1O15126 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SCAMP1O15126 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.6 ms