Protein–RNA interactions for Protein: O15061

SYNM, Synemin, humanhuman

Predictions only

Length 1,565 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNMO15061 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
SYNMO15061 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
SYNMO15061 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC36.13■■■■□ 3.37
SYNMO15061 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC36.12■■■■□ 3.37
SYNMO15061 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
SYNMO15061 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC36.12■■■■□ 3.37
SYNMO15061 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
SYNMO15061 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
SYNMO15061 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC36.11■■■■□ 3.37
SYNMO15061 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC36.11■■■■□ 3.37
SYNMO15061 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC36.1■■■■□ 3.37
SYNMO15061 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.1■■■■□ 3.37
SYNMO15061 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC36.1■■■■□ 3.37
SYNMO15061 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC36.1■■■■□ 3.37
SYNMO15061 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC36.09■■■■□ 3.37
SYNMO15061 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
SYNMO15061 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
SYNMO15061 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
SYNMO15061 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC36.08■■■■□ 3.37
SYNMO15061 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC36.08■■■■□ 3.37
SYNMO15061 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC36.07■■■■□ 3.37
SYNMO15061 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC36.07■■■■□ 3.37
SYNMO15061 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC36.07■■■■□ 3.37
SYNMO15061 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC36.06■■■■□ 3.36
SYNMO15061 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
SYNMO15061 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
SYNMO15061 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
SYNMO15061 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC36.06■■■■□ 3.36
SYNMO15061 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
SYNMO15061 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
SYNMO15061 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC36.05■■■■□ 3.36
SYNMO15061 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC36.05■■■■□ 3.36
SYNMO15061 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
SYNMO15061 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
SYNMO15061 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC36.04■■■■□ 3.36
SYNMO15061 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
SYNMO15061 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC36.04■■■■□ 3.36
SYNMO15061 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC36.04■■■■□ 3.36
SYNMO15061 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.03■■■■□ 3.36
SYNMO15061 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC36.03■■■■□ 3.36
SYNMO15061 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC36.03■■■■□ 3.36
SYNMO15061 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
SYNMO15061 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC36.02■■■■□ 3.36
SYNMO15061 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.35
SYNMO15061 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.35
SYNMO15061 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC36■■■■□ 3.35
SYNMO15061 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC36■■■■□ 3.35
SYNMO15061 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC36■■■■□ 3.35
SYNMO15061 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
SYNMO15061 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.98■■■■□ 3.35
SYNMO15061 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
SYNMO15061 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
SYNMO15061 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
SYNMO15061 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.97■■■■□ 3.35
SYNMO15061 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
SYNMO15061 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
SYNMO15061 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC35.96■■■■□ 3.35
SYNMO15061 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC35.96■■■■□ 3.35
SYNMO15061 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.95■■■■□ 3.35
SYNMO15061 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
SYNMO15061 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC35.94■■■■□ 3.34
SYNMO15061 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC35.94■■■■□ 3.34
SYNMO15061 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
SYNMO15061 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.94■■■■□ 3.34
SYNMO15061 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
SYNMO15061 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
SYNMO15061 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
SYNMO15061 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC35.94■■■■□ 3.34
SYNMO15061 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC35.94■■■■□ 3.34
SYNMO15061 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC35.93■■■■□ 3.34
SYNMO15061 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC35.93■■■■□ 3.34
SYNMO15061 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
SYNMO15061 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC35.93■■■■□ 3.34
SYNMO15061 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC35.92■■■■□ 3.34
SYNMO15061 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
SYNMO15061 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC35.91■■■■□ 3.34
SYNMO15061 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC35.91■■■■□ 3.34
SYNMO15061 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
SYNMO15061 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC35.91■■■■□ 3.34
SYNMO15061 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC35.91■■■■□ 3.34
SYNMO15061 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC35.9■■■■□ 3.34
SYNMO15061 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
SYNMO15061 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
SYNMO15061 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC35.89■■■■□ 3.34
SYNMO15061 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC35.89■■■■□ 3.34
SYNMO15061 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.89■■■■□ 3.34
SYNMO15061 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
SYNMO15061 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
SYNMO15061 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.88■■■■□ 3.33
SYNMO15061 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
SYNMO15061 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
SYNMO15061 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
SYNMO15061 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
SYNMO15061 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
SYNMO15061 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC35.85■■■■□ 3.33
SYNMO15061 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
SYNMO15061 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC35.85■■■■□ 3.33
SYNMO15061 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC35.85■■■■□ 3.33
SYNMO15061 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
SYNMO15061 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC35.85■■■■□ 3.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms