Protein–RNA interactions for Protein: O15041

SEMA3E, Semaphorin-3E, humanhuman

Predictions only

Length 775 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3EO15041 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
SEMA3EO15041 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
SEMA3EO15041 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
SEMA3EO15041 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
SEMA3EO15041 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
SEMA3EO15041 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
SEMA3EO15041 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
SEMA3EO15041 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
SEMA3EO15041 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
SEMA3EO15041 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
SEMA3EO15041 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
SEMA3EO15041 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.37
SEMA3EO15041 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
SEMA3EO15041 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
SEMA3EO15041 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
SEMA3EO15041 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
SEMA3EO15041 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
SEMA3EO15041 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
SEMA3EO15041 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC29.88■■■□□ 2.37
SEMA3EO15041 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
SEMA3EO15041 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
SEMA3EO15041 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
SEMA3EO15041 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
SEMA3EO15041 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
SEMA3EO15041 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
SEMA3EO15041 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC29.87■■■□□ 2.37
SEMA3EO15041 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
SEMA3EO15041 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC29.86■■■□□ 2.37
SEMA3EO15041 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
SEMA3EO15041 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC29.86■■■□□ 2.37
SEMA3EO15041 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
SEMA3EO15041 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
SEMA3EO15041 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
SEMA3EO15041 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC29.85■■■□□ 2.37
SEMA3EO15041 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
SEMA3EO15041 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
SEMA3EO15041 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC29.84■■■□□ 2.37
SEMA3EO15041 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC29.84■■■□□ 2.37
SEMA3EO15041 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC29.84■■■□□ 2.37
SEMA3EO15041 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
SEMA3EO15041 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
SEMA3EO15041 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
SEMA3EO15041 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
SEMA3EO15041 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
SEMA3EO15041 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
SEMA3EO15041 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
SEMA3EO15041 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC29.82■■■□□ 2.36
SEMA3EO15041 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC29.82■■■□□ 2.36
SEMA3EO15041 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
SEMA3EO15041 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
SEMA3EO15041 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
SEMA3EO15041 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
SEMA3EO15041 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
SEMA3EO15041 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
SEMA3EO15041 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
SEMA3EO15041 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
SEMA3EO15041 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
SEMA3EO15041 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
SEMA3EO15041 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
SEMA3EO15041 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
SEMA3EO15041 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
SEMA3EO15041 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
SEMA3EO15041 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
SEMA3EO15041 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
SEMA3EO15041 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
SEMA3EO15041 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
SEMA3EO15041 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
SEMA3EO15041 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC29.78■■■□□ 2.36
SEMA3EO15041 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
SEMA3EO15041 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
SEMA3EO15041 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
SEMA3EO15041 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
SEMA3EO15041 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
SEMA3EO15041 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
SEMA3EO15041 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC29.76■■■□□ 2.35
SEMA3EO15041 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC29.76■■■□□ 2.35
SEMA3EO15041 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
SEMA3EO15041 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
SEMA3EO15041 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
SEMA3EO15041 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
SEMA3EO15041 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
SEMA3EO15041 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
SEMA3EO15041 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC29.74■■■□□ 2.35
SEMA3EO15041 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
SEMA3EO15041 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC29.74■■■□□ 2.35
SEMA3EO15041 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
SEMA3EO15041 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC29.73■■■□□ 2.35
SEMA3EO15041 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC29.73■■■□□ 2.35
SEMA3EO15041 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
SEMA3EO15041 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
SEMA3EO15041 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
SEMA3EO15041 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
SEMA3EO15041 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
SEMA3EO15041 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
SEMA3EO15041 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
SEMA3EO15041 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
SEMA3EO15041 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.35
SEMA3EO15041 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.35
SEMA3EO15041 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.34
SEMA3EO15041 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.7■■■□□ 2.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms