Protein–RNA interactions for Protein: O14967

CLGN, Calmegin, humanhuman

Predictions only

Length 610 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLGNO14967 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CLGNO14967 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CLGNO14967 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CLGNO14967 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CLGNO14967 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CLGNO14967 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
CLGNO14967 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
CLGNO14967 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
CLGNO14967 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CLGNO14967 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CLGNO14967 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
CLGNO14967 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
CLGNO14967 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
CLGNO14967 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
CLGNO14967 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
CLGNO14967 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
CLGNO14967 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
CLGNO14967 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
CLGNO14967 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
CLGNO14967 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CLGNO14967 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
CLGNO14967 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CLGNO14967 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CLGNO14967 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
CLGNO14967 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CLGNO14967 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CLGNO14967 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CLGNO14967 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CLGNO14967 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
CLGNO14967 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CLGNO14967 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CLGNO14967 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CLGNO14967 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CLGNO14967 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CLGNO14967 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CLGNO14967 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CLGNO14967 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CLGNO14967 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CLGNO14967 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CLGNO14967 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CLGNO14967 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CLGNO14967 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CLGNO14967 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CLGNO14967 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CLGNO14967 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CLGNO14967 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CLGNO14967 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CLGNO14967 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CLGNO14967 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CLGNO14967 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CLGNO14967 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CLGNO14967 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CLGNO14967 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CLGNO14967 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CLGNO14967 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CLGNO14967 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CLGNO14967 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CLGNO14967 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CLGNO14967 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CLGNO14967 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CLGNO14967 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CLGNO14967 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CLGNO14967 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CLGNO14967 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CLGNO14967 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CLGNO14967 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CLGNO14967 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CLGNO14967 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CLGNO14967 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CLGNO14967 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CLGNO14967 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CLGNO14967 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CLGNO14967 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CLGNO14967 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CLGNO14967 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
CLGNO14967 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CLGNO14967 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CLGNO14967 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CLGNO14967 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CLGNO14967 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CLGNO14967 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CLGNO14967 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CLGNO14967 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CLGNO14967 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CLGNO14967 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
CLGNO14967 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CLGNO14967 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CLGNO14967 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CLGNO14967 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CLGNO14967 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CLGNO14967 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CLGNO14967 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CLGNO14967 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CLGNO14967 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CLGNO14967 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CLGNO14967 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CLGNO14967 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CLGNO14967 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CLGNO14967 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CLGNO14967 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.4 ms