Protein–RNA interactions for Protein: O00548

DLL1, Delta-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 723 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DLL1O00548 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
DLL1O00548 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
DLL1O00548 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
DLL1O00548 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
DLL1O00548 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
DLL1O00548 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
DLL1O00548 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
DLL1O00548 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
DLL1O00548 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
DLL1O00548 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
DLL1O00548 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
DLL1O00548 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
DLL1O00548 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
DLL1O00548 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
DLL1O00548 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
DLL1O00548 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
DLL1O00548 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
DLL1O00548 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
DLL1O00548 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
DLL1O00548 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
DLL1O00548 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
DLL1O00548 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
DLL1O00548 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
DLL1O00548 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
DLL1O00548 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
DLL1O00548 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
DLL1O00548 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
DLL1O00548 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
DLL1O00548 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
DLL1O00548 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC25.83■■□□□ 1.73
DLL1O00548 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
DLL1O00548 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
DLL1O00548 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
DLL1O00548 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
DLL1O00548 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
DLL1O00548 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
DLL1O00548 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
DLL1O00548 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
DLL1O00548 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
DLL1O00548 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
DLL1O00548 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
DLL1O00548 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
DLL1O00548 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
DLL1O00548 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
DLL1O00548 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
DLL1O00548 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
DLL1O00548 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
DLL1O00548 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
DLL1O00548 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
DLL1O00548 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
DLL1O00548 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
DLL1O00548 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
DLL1O00548 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
DLL1O00548 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
DLL1O00548 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
DLL1O00548 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
DLL1O00548 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
DLL1O00548 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
DLL1O00548 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
DLL1O00548 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
DLL1O00548 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
DLL1O00548 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
DLL1O00548 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
DLL1O00548 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
DLL1O00548 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
DLL1O00548 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
DLL1O00548 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
DLL1O00548 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
DLL1O00548 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
DLL1O00548 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
DLL1O00548 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
DLL1O00548 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
DLL1O00548 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
DLL1O00548 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
DLL1O00548 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
DLL1O00548 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
DLL1O00548 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
DLL1O00548 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC25.72■■□□□ 1.71
DLL1O00548 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
DLL1O00548 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
DLL1O00548 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
DLL1O00548 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
DLL1O00548 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
DLL1O00548 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
DLL1O00548 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
DLL1O00548 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
DLL1O00548 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
DLL1O00548 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.7
DLL1O00548 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
DLL1O00548 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
DLL1O00548 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
DLL1O00548 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
DLL1O00548 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
DLL1O00548 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
DLL1O00548 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
DLL1O00548 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
DLL1O00548 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
DLL1O00548 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
DLL1O00548 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
DLL1O00548 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms