Protein–RNA interactions for Protein: O00468

AGRN, Agrin, humanhuman

Predictions only

Length 2,067 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGRNO00468 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
AGRNO00468 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
AGRNO00468 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
AGRNO00468 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
AGRNO00468 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
AGRNO00468 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
AGRNO00468 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
AGRNO00468 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
AGRNO00468 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
AGRNO00468 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
AGRNO00468 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
AGRNO00468 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
AGRNO00468 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
AGRNO00468 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
AGRNO00468 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
AGRNO00468 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
AGRNO00468 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
AGRNO00468 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
AGRNO00468 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
AGRNO00468 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
AGRNO00468 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
AGRNO00468 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
AGRNO00468 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
AGRNO00468 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
AGRNO00468 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
AGRNO00468 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
AGRNO00468 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
AGRNO00468 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
AGRNO00468 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
AGRNO00468 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
AGRNO00468 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
AGRNO00468 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
AGRNO00468 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
AGRNO00468 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
AGRNO00468 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
AGRNO00468 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
AGRNO00468 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
AGRNO00468 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
AGRNO00468 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
AGRNO00468 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
AGRNO00468 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
AGRNO00468 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
AGRNO00468 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
AGRNO00468 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
AGRNO00468 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
AGRNO00468 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
AGRNO00468 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
AGRNO00468 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
AGRNO00468 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
AGRNO00468 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
AGRNO00468 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
AGRNO00468 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
AGRNO00468 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
AGRNO00468 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.51
AGRNO00468 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
AGRNO00468 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
AGRNO00468 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
AGRNO00468 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
AGRNO00468 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
AGRNO00468 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
AGRNO00468 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
AGRNO00468 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
AGRNO00468 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
AGRNO00468 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
AGRNO00468 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
AGRNO00468 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
AGRNO00468 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
AGRNO00468 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
AGRNO00468 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
AGRNO00468 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
AGRNO00468 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
AGRNO00468 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
AGRNO00468 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
AGRNO00468 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
AGRNO00468 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
AGRNO00468 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
AGRNO00468 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
AGRNO00468 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
AGRNO00468 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
AGRNO00468 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
AGRNO00468 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
AGRNO00468 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
AGRNO00468 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
AGRNO00468 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
AGRNO00468 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
AGRNO00468 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
AGRNO00468 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
AGRNO00468 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
AGRNO00468 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
AGRNO00468 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
AGRNO00468 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
AGRNO00468 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
AGRNO00468 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
AGRNO00468 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
AGRNO00468 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
AGRNO00468 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
AGRNO00468 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
AGRNO00468 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
AGRNO00468 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
AGRNO00468 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 103.3 ms