Protein–RNA interactions for Protein: J3QR89

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 54 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
J3QR89 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
J3QR89 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
J3QR89 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
J3QR89 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
J3QR89 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
J3QR89 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
J3QR89 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
J3QR89 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
J3QR89 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
J3QR89 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
J3QR89 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
J3QR89 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
J3QR89 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
J3QR89 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
J3QR89 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
J3QR89 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
J3QR89 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
J3QR89 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
J3QR89 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
J3QR89 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
J3QR89 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
J3QR89 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
J3QR89 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
J3QR89 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
J3QR89 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
J3QR89 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
J3QR89 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
J3QR89 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
J3QR89 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
J3QR89 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
J3QR89 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
J3QR89 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
J3QR89 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
J3QR89 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
J3QR89 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
J3QR89 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
J3QR89 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
J3QR89 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
J3QR89 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
J3QR89 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
J3QR89 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
J3QR89 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
J3QR89 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
J3QR89 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
J3QR89 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
J3QR89 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
J3QR89 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
J3QR89 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
J3QR89 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
J3QR89 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
J3QR89 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
J3QR89 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
J3QR89 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
J3QR89 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
J3QR89 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
J3QR89 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
J3QR89 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
J3QR89 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
J3QR89 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
J3QR89 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
J3QR89 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
J3QR89 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
J3QR89 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
J3QR89 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
J3QR89 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
J3QR89 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
J3QR89 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
J3QR89 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
J3QR89 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
J3QR89 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
J3QR89 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
J3QR89 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
J3QR89 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
J3QR89 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
J3QR89 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
J3QR89 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
J3QR89 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
J3QR89 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
J3QR89 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
J3QR89 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
J3QR89 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
J3QR89 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
J3QR89 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
J3QR89 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
J3QR89 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
J3QR89 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
J3QR89 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
J3QR89 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
J3QR89 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
J3QR89 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
J3QR89 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
J3QR89 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
J3QR89 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
J3QR89 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
J3QR89 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
J3QR89 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
J3QR89 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
J3QR89 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
J3QR89 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
J3QR89 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.1 ms