Protein–RNA interactions for Protein: H3BQW9

FAM229A, Protein FAM229A, humanhuman

Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM229AH3BQW9 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FAM229AH3BQW9 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FAM229AH3BQW9 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FAM229AH3BQW9 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FAM229AH3BQW9 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FAM229AH3BQW9 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FAM229AH3BQW9 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FAM229AH3BQW9 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FAM229AH3BQW9 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FAM229AH3BQW9 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FAM229AH3BQW9 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FAM229AH3BQW9 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
FAM229AH3BQW9 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
FAM229AH3BQW9 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
FAM229AH3BQW9 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FAM229AH3BQW9 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
FAM229AH3BQW9 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
FAM229AH3BQW9 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
FAM229AH3BQW9 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
FAM229AH3BQW9 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
FAM229AH3BQW9 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
FAM229AH3BQW9 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
FAM229AH3BQW9 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
FAM229AH3BQW9 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
FAM229AH3BQW9 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
FAM229AH3BQW9 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
FAM229AH3BQW9 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
FAM229AH3BQW9 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
FAM229AH3BQW9 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
FAM229AH3BQW9 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
FAM229AH3BQW9 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
FAM229AH3BQW9 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
FAM229AH3BQW9 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
FAM229AH3BQW9 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
FAM229AH3BQW9 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
FAM229AH3BQW9 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FAM229AH3BQW9 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FAM229AH3BQW9 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
FAM229AH3BQW9 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
FAM229AH3BQW9 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FAM229AH3BQW9 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FAM229AH3BQW9 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FAM229AH3BQW9 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FAM229AH3BQW9 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FAM229AH3BQW9 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
FAM229AH3BQW9 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FAM229AH3BQW9 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FAM229AH3BQW9 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FAM229AH3BQW9 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FAM229AH3BQW9 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FAM229AH3BQW9 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FAM229AH3BQW9 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
FAM229AH3BQW9 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FAM229AH3BQW9 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FAM229AH3BQW9 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FAM229AH3BQW9 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FAM229AH3BQW9 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FAM229AH3BQW9 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FAM229AH3BQW9 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FAM229AH3BQW9 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FAM229AH3BQW9 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FAM229AH3BQW9 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FAM229AH3BQW9 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FAM229AH3BQW9 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FAM229AH3BQW9 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FAM229AH3BQW9 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FAM229AH3BQW9 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FAM229AH3BQW9 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
FAM229AH3BQW9 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
FAM229AH3BQW9 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
FAM229AH3BQW9 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FAM229AH3BQW9 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FAM229AH3BQW9 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FAM229AH3BQW9 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FAM229AH3BQW9 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FAM229AH3BQW9 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FAM229AH3BQW9 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FAM229AH3BQW9 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FAM229AH3BQW9 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FAM229AH3BQW9 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FAM229AH3BQW9 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
FAM229AH3BQW9 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
FAM229AH3BQW9 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
FAM229AH3BQW9 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
FAM229AH3BQW9 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
FAM229AH3BQW9 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
FAM229AH3BQW9 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
FAM229AH3BQW9 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
FAM229AH3BQW9 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
FAM229AH3BQW9 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
FAM229AH3BQW9 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
FAM229AH3BQW9 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
FAM229AH3BQW9 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
FAM229AH3BQW9 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
FAM229AH3BQW9 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
FAM229AH3BQW9 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
FAM229AH3BQW9 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
FAM229AH3BQW9 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
FAM229AH3BQW9 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
FAM229AH3BQW9 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11 ms