Protein–RNA interactions for Protein: B6A8C7

TARM1, T-cell-interacting, activating receptor on myeloid cells protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 271 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TARM1B6A8C7 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TARM1B6A8C7 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TARM1B6A8C7 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TARM1B6A8C7 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TARM1B6A8C7 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TARM1B6A8C7 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TARM1B6A8C7 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TARM1B6A8C7 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TARM1B6A8C7 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TARM1B6A8C7 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TARM1B6A8C7 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TARM1B6A8C7 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TARM1B6A8C7 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TARM1B6A8C7 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TARM1B6A8C7 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TARM1B6A8C7 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TARM1B6A8C7 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TARM1B6A8C7 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TARM1B6A8C7 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TARM1B6A8C7 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TARM1B6A8C7 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TARM1B6A8C7 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TARM1B6A8C7 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TARM1B6A8C7 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TARM1B6A8C7 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TARM1B6A8C7 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TARM1B6A8C7 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TARM1B6A8C7 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
TARM1B6A8C7 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TARM1B6A8C7 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TARM1B6A8C7 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TARM1B6A8C7 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TARM1B6A8C7 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TARM1B6A8C7 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TARM1B6A8C7 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TARM1B6A8C7 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TARM1B6A8C7 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TARM1B6A8C7 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TARM1B6A8C7 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TARM1B6A8C7 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TARM1B6A8C7 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TARM1B6A8C7 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TARM1B6A8C7 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TARM1B6A8C7 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TARM1B6A8C7 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TARM1B6A8C7 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TARM1B6A8C7 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TARM1B6A8C7 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TARM1B6A8C7 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TARM1B6A8C7 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TARM1B6A8C7 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TARM1B6A8C7 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TARM1B6A8C7 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TARM1B6A8C7 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TARM1B6A8C7 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TARM1B6A8C7 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TARM1B6A8C7 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TARM1B6A8C7 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TARM1B6A8C7 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TARM1B6A8C7 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TARM1B6A8C7 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TARM1B6A8C7 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TARM1B6A8C7 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TARM1B6A8C7 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TARM1B6A8C7 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TARM1B6A8C7 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TARM1B6A8C7 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TARM1B6A8C7 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TARM1B6A8C7 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TARM1B6A8C7 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TARM1B6A8C7 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
TARM1B6A8C7 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TARM1B6A8C7 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TARM1B6A8C7 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TARM1B6A8C7 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TARM1B6A8C7 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TARM1B6A8C7 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TARM1B6A8C7 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TARM1B6A8C7 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TARM1B6A8C7 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TARM1B6A8C7 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TARM1B6A8C7 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TARM1B6A8C7 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TARM1B6A8C7 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TARM1B6A8C7 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TARM1B6A8C7 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TARM1B6A8C7 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
TARM1B6A8C7 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TARM1B6A8C7 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TARM1B6A8C7 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TARM1B6A8C7 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TARM1B6A8C7 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TARM1B6A8C7 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TARM1B6A8C7 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TARM1B6A8C7 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TARM1B6A8C7 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TARM1B6A8C7 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TARM1B6A8C7 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TARM1B6A8C7 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TARM1B6A8C7 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms