Protein–RNA interactions for Protein: A8MXY4

ZNF99, Zinc finger protein 99, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 864 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF99A8MXY4 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
ZNF99A8MXY4 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ZNF99A8MXY4 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ZNF99A8MXY4 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ZNF99A8MXY4 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ZNF99A8MXY4 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ZNF99A8MXY4 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ZNF99A8MXY4 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ZNF99A8MXY4 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
ZNF99A8MXY4 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ZNF99A8MXY4 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ZNF99A8MXY4 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ZNF99A8MXY4 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ZNF99A8MXY4 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ZNF99A8MXY4 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
ZNF99A8MXY4 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ZNF99A8MXY4 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
ZNF99A8MXY4 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
ZNF99A8MXY4 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZNF99A8MXY4 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZNF99A8MXY4 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZNF99A8MXY4 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ZNF99A8MXY4 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ZNF99A8MXY4 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ZNF99A8MXY4 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ZNF99A8MXY4 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ZNF99A8MXY4 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ZNF99A8MXY4 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
ZNF99A8MXY4 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ZNF99A8MXY4 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ZNF99A8MXY4 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ZNF99A8MXY4 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ZNF99A8MXY4 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ZNF99A8MXY4 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ZNF99A8MXY4 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ZNF99A8MXY4 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ZNF99A8MXY4 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
ZNF99A8MXY4 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ZNF99A8MXY4 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ZNF99A8MXY4 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ZNF99A8MXY4 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ZNF99A8MXY4 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ZNF99A8MXY4 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ZNF99A8MXY4 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ZNF99A8MXY4 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ZNF99A8MXY4 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ZNF99A8MXY4 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ZNF99A8MXY4 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ZNF99A8MXY4 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZNF99A8MXY4 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZNF99A8MXY4 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
ZNF99A8MXY4 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZNF99A8MXY4 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
ZNF99A8MXY4 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZNF99A8MXY4 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZNF99A8MXY4 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZNF99A8MXY4 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ZNF99A8MXY4 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ZNF99A8MXY4 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZNF99A8MXY4 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZNF99A8MXY4 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZNF99A8MXY4 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZNF99A8MXY4 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZNF99A8MXY4 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZNF99A8MXY4 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZNF99A8MXY4 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZNF99A8MXY4 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZNF99A8MXY4 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZNF99A8MXY4 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZNF99A8MXY4 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZNF99A8MXY4 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZNF99A8MXY4 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZNF99A8MXY4 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZNF99A8MXY4 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZNF99A8MXY4 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
ZNF99A8MXY4 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
ZNF99A8MXY4 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
ZNF99A8MXY4 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
ZNF99A8MXY4 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
ZNF99A8MXY4 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ZNF99A8MXY4 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ZNF99A8MXY4 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ZNF99A8MXY4 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ZNF99A8MXY4 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ZNF99A8MXY4 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZNF99A8MXY4 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZNF99A8MXY4 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZNF99A8MXY4 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZNF99A8MXY4 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZNF99A8MXY4 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZNF99A8MXY4 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZNF99A8MXY4 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ZNF99A8MXY4 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ZNF99A8MXY4 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ZNF99A8MXY4 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
ZNF99A8MXY4 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ZNF99A8MXY4 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ZNF99A8MXY4 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ZNF99A8MXY4 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ZNF99A8MXY4 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 143.4 ms