Protein–RNA interactions for Protein: A8MT33

SYCE1L, Synaptonemal complex central element protein 1-like, humanhuman

Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCE1LA8MT33 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
SYCE1LA8MT33 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SYCE1LA8MT33 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SYCE1LA8MT33 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SYCE1LA8MT33 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SYCE1LA8MT33 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SYCE1LA8MT33 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SYCE1LA8MT33 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SYCE1LA8MT33 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SYCE1LA8MT33 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SYCE1LA8MT33 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SYCE1LA8MT33 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
SYCE1LA8MT33 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
SYCE1LA8MT33 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
SYCE1LA8MT33 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SYCE1LA8MT33 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SYCE1LA8MT33 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SYCE1LA8MT33 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SYCE1LA8MT33 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SYCE1LA8MT33 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SYCE1LA8MT33 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SYCE1LA8MT33 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SYCE1LA8MT33 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SYCE1LA8MT33 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SYCE1LA8MT33 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SYCE1LA8MT33 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SYCE1LA8MT33 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SYCE1LA8MT33 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SYCE1LA8MT33 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SYCE1LA8MT33 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SYCE1LA8MT33 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SYCE1LA8MT33 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SYCE1LA8MT33 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SYCE1LA8MT33 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SYCE1LA8MT33 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SYCE1LA8MT33 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SYCE1LA8MT33 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SYCE1LA8MT33 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SYCE1LA8MT33 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SYCE1LA8MT33 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SYCE1LA8MT33 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SYCE1LA8MT33 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SYCE1LA8MT33 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SYCE1LA8MT33 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SYCE1LA8MT33 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SYCE1LA8MT33 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
SYCE1LA8MT33 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SYCE1LA8MT33 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SYCE1LA8MT33 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SYCE1LA8MT33 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SYCE1LA8MT33 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.43
SYCE1LA8MT33 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SYCE1LA8MT33 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SYCE1LA8MT33 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SYCE1LA8MT33 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SYCE1LA8MT33 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
SYCE1LA8MT33 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SYCE1LA8MT33 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SYCE1LA8MT33 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
SYCE1LA8MT33 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
SYCE1LA8MT33 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SYCE1LA8MT33 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SYCE1LA8MT33 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SYCE1LA8MT33 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SYCE1LA8MT33 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
SYCE1LA8MT33 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
SYCE1LA8MT33 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SYCE1LA8MT33 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SYCE1LA8MT33 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SYCE1LA8MT33 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SYCE1LA8MT33 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SYCE1LA8MT33 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SYCE1LA8MT33 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SYCE1LA8MT33 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SYCE1LA8MT33 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SYCE1LA8MT33 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SYCE1LA8MT33 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SYCE1LA8MT33 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SYCE1LA8MT33 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
SYCE1LA8MT33 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
SYCE1LA8MT33 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SYCE1LA8MT33 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SYCE1LA8MT33 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SYCE1LA8MT33 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SYCE1LA8MT33 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SYCE1LA8MT33 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SYCE1LA8MT33 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SYCE1LA8MT33 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SYCE1LA8MT33 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC23.95■■□□□ 1.43
SYCE1LA8MT33 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SYCE1LA8MT33 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SYCE1LA8MT33 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SYCE1LA8MT33 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SYCE1LA8MT33 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SYCE1LA8MT33 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SYCE1LA8MT33 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SYCE1LA8MT33 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SYCE1LA8MT33 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SYCE1LA8MT33 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SYCE1LA8MT33 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.2 ms