Protein–RNA interactions for Protein: A6NKB5

PCNX2, Pecanex-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 2,137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCNX2A6NKB5 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
PCNX2A6NKB5 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PCNX2A6NKB5 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PCNX2A6NKB5 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PCNX2A6NKB5 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PCNX2A6NKB5 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PCNX2A6NKB5 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PCNX2A6NKB5 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PCNX2A6NKB5 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PCNX2A6NKB5 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
PCNX2A6NKB5 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PCNX2A6NKB5 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PCNX2A6NKB5 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PCNX2A6NKB5 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PCNX2A6NKB5 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PCNX2A6NKB5 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PCNX2A6NKB5 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
PCNX2A6NKB5 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
PCNX2A6NKB5 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PCNX2A6NKB5 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
PCNX2A6NKB5 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PCNX2A6NKB5 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PCNX2A6NKB5 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PCNX2A6NKB5 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PCNX2A6NKB5 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PCNX2A6NKB5 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PCNX2A6NKB5 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PCNX2A6NKB5 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PCNX2A6NKB5 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PCNX2A6NKB5 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PCNX2A6NKB5 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PCNX2A6NKB5 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PCNX2A6NKB5 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PCNX2A6NKB5 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PCNX2A6NKB5 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PCNX2A6NKB5 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PCNX2A6NKB5 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PCNX2A6NKB5 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PCNX2A6NKB5 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PCNX2A6NKB5 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PCNX2A6NKB5 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PCNX2A6NKB5 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PCNX2A6NKB5 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PCNX2A6NKB5 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PCNX2A6NKB5 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PCNX2A6NKB5 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PCNX2A6NKB5 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
PCNX2A6NKB5 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
PCNX2A6NKB5 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.42
PCNX2A6NKB5 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PCNX2A6NKB5 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PCNX2A6NKB5 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PCNX2A6NKB5 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PCNX2A6NKB5 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PCNX2A6NKB5 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PCNX2A6NKB5 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
PCNX2A6NKB5 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
PCNX2A6NKB5 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PCNX2A6NKB5 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PCNX2A6NKB5 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PCNX2A6NKB5 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PCNX2A6NKB5 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PCNX2A6NKB5 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PCNX2A6NKB5 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PCNX2A6NKB5 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PCNX2A6NKB5 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PCNX2A6NKB5 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
PCNX2A6NKB5 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PCNX2A6NKB5 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PCNX2A6NKB5 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
PCNX2A6NKB5 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.4
PCNX2A6NKB5 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PCNX2A6NKB5 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PCNX2A6NKB5 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PCNX2A6NKB5 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PCNX2A6NKB5 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PCNX2A6NKB5 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PCNX2A6NKB5 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PCNX2A6NKB5 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
PCNX2A6NKB5 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PCNX2A6NKB5 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
PCNX2A6NKB5 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PCNX2A6NKB5 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PCNX2A6NKB5 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PCNX2A6NKB5 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PCNX2A6NKB5 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PCNX2A6NKB5 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
PCNX2A6NKB5 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
PCNX2A6NKB5 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PCNX2A6NKB5 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PCNX2A6NKB5 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
PCNX2A6NKB5 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PCNX2A6NKB5 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PCNX2A6NKB5 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
PCNX2A6NKB5 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PCNX2A6NKB5 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PCNX2A6NKB5 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PCNX2A6NKB5 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PCNX2A6NKB5 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PCNX2A6NKB5 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms