Protein–RNA interactions for Protein: A6NIR3

AGAP5, Arf-GAP with GTPase, ANK repeat and PH domain-containing protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 686 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGAP5A6NIR3 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
AGAP5A6NIR3 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
AGAP5A6NIR3 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
AGAP5A6NIR3 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
AGAP5A6NIR3 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
AGAP5A6NIR3 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
AGAP5A6NIR3 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
AGAP5A6NIR3 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
AGAP5A6NIR3 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
AGAP5A6NIR3 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
AGAP5A6NIR3 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
AGAP5A6NIR3 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
AGAP5A6NIR3 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
AGAP5A6NIR3 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
AGAP5A6NIR3 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
AGAP5A6NIR3 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
AGAP5A6NIR3 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
AGAP5A6NIR3 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
AGAP5A6NIR3 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
AGAP5A6NIR3 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
AGAP5A6NIR3 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
AGAP5A6NIR3 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
AGAP5A6NIR3 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
AGAP5A6NIR3 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
AGAP5A6NIR3 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
AGAP5A6NIR3 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
AGAP5A6NIR3 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
AGAP5A6NIR3 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
AGAP5A6NIR3 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
AGAP5A6NIR3 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
AGAP5A6NIR3 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
AGAP5A6NIR3 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
AGAP5A6NIR3 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
AGAP5A6NIR3 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
AGAP5A6NIR3 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
AGAP5A6NIR3 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
AGAP5A6NIR3 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
AGAP5A6NIR3 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
AGAP5A6NIR3 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
AGAP5A6NIR3 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
AGAP5A6NIR3 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
AGAP5A6NIR3 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
AGAP5A6NIR3 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
AGAP5A6NIR3 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
AGAP5A6NIR3 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
AGAP5A6NIR3 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
AGAP5A6NIR3 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
AGAP5A6NIR3 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
AGAP5A6NIR3 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
AGAP5A6NIR3 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
AGAP5A6NIR3 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
AGAP5A6NIR3 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
AGAP5A6NIR3 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
AGAP5A6NIR3 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
AGAP5A6NIR3 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
AGAP5A6NIR3 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
AGAP5A6NIR3 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
AGAP5A6NIR3 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
AGAP5A6NIR3 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
AGAP5A6NIR3 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
AGAP5A6NIR3 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
AGAP5A6NIR3 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
AGAP5A6NIR3 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
AGAP5A6NIR3 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
AGAP5A6NIR3 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
AGAP5A6NIR3 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
AGAP5A6NIR3 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
AGAP5A6NIR3 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
AGAP5A6NIR3 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
AGAP5A6NIR3 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
AGAP5A6NIR3 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.7■■□□□ 1.23
AGAP5A6NIR3 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
AGAP5A6NIR3 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
AGAP5A6NIR3 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
AGAP5A6NIR3 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
AGAP5A6NIR3 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
AGAP5A6NIR3 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
AGAP5A6NIR3 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
AGAP5A6NIR3 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
AGAP5A6NIR3 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
AGAP5A6NIR3 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
AGAP5A6NIR3 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
AGAP5A6NIR3 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
AGAP5A6NIR3 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
AGAP5A6NIR3 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
AGAP5A6NIR3 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
AGAP5A6NIR3 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
AGAP5A6NIR3 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
AGAP5A6NIR3 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
AGAP5A6NIR3 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
AGAP5A6NIR3 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
AGAP5A6NIR3 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
AGAP5A6NIR3 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
AGAP5A6NIR3 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
AGAP5A6NIR3 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
AGAP5A6NIR3 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
AGAP5A6NIR3 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
AGAP5A6NIR3 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
AGAP5A6NIR3 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
AGAP5A6NIR3 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms