Protein–RNA interactions for Protein: A6NH52

TVP23A, Golgi apparatus membrane protein TVP23 homolog A, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TVP23AA6NH52 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TVP23AA6NH52 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TVP23AA6NH52 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TVP23AA6NH52 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TVP23AA6NH52 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TVP23AA6NH52 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TVP23AA6NH52 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TVP23AA6NH52 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TVP23AA6NH52 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TVP23AA6NH52 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TVP23AA6NH52 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TVP23AA6NH52 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TVP23AA6NH52 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TVP23AA6NH52 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TVP23AA6NH52 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TVP23AA6NH52 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TVP23AA6NH52 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TVP23AA6NH52 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TVP23AA6NH52 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TVP23AA6NH52 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TVP23AA6NH52 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TVP23AA6NH52 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TVP23AA6NH52 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TVP23AA6NH52 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TVP23AA6NH52 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
TVP23AA6NH52 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TVP23AA6NH52 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TVP23AA6NH52 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TVP23AA6NH52 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TVP23AA6NH52 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TVP23AA6NH52 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TVP23AA6NH52 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
TVP23AA6NH52 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TVP23AA6NH52 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TVP23AA6NH52 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TVP23AA6NH52 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TVP23AA6NH52 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TVP23AA6NH52 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TVP23AA6NH52 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TVP23AA6NH52 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TVP23AA6NH52 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TVP23AA6NH52 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TVP23AA6NH52 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TVP23AA6NH52 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TVP23AA6NH52 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TVP23AA6NH52 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
TVP23AA6NH52 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TVP23AA6NH52 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TVP23AA6NH52 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
TVP23AA6NH52 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TVP23AA6NH52 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TVP23AA6NH52 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TVP23AA6NH52 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TVP23AA6NH52 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TVP23AA6NH52 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TVP23AA6NH52 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TVP23AA6NH52 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TVP23AA6NH52 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TVP23AA6NH52 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TVP23AA6NH52 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TVP23AA6NH52 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TVP23AA6NH52 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
TVP23AA6NH52 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TVP23AA6NH52 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TVP23AA6NH52 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TVP23AA6NH52 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TVP23AA6NH52 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TVP23AA6NH52 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TVP23AA6NH52 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TVP23AA6NH52 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TVP23AA6NH52 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TVP23AA6NH52 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TVP23AA6NH52 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TVP23AA6NH52 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TVP23AA6NH52 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
TVP23AA6NH52 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TVP23AA6NH52 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TVP23AA6NH52 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TVP23AA6NH52 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TVP23AA6NH52 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TVP23AA6NH52 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TVP23AA6NH52 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TVP23AA6NH52 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TVP23AA6NH52 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TVP23AA6NH52 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
TVP23AA6NH52 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TVP23AA6NH52 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TVP23AA6NH52 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TVP23AA6NH52 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TVP23AA6NH52 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TVP23AA6NH52 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TVP23AA6NH52 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
TVP23AA6NH52 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TVP23AA6NH52 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TVP23AA6NH52 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TVP23AA6NH52 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TVP23AA6NH52 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TVP23AA6NH52 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TVP23AA6NH52 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TVP23AA6NH52 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms