Protein–RNA interactions for Protein: A6NFI3

ZNF316, Zinc finger protein 316, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,004 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF316A6NFI3 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
ZNF316A6NFI3 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
ZNF316A6NFI3 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
ZNF316A6NFI3 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.91■■■■□ 3.18
ZNF316A6NFI3 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
ZNF316A6NFI3 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
ZNF316A6NFI3 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC34.9■■■■□ 3.18
ZNF316A6NFI3 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
ZNF316A6NFI3 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
ZNF316A6NFI3 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC34.88■■■■□ 3.17
ZNF316A6NFI3 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.88■■■■□ 3.17
ZNF316A6NFI3 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC34.87■■■■□ 3.17
ZNF316A6NFI3 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
ZNF316A6NFI3 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
ZNF316A6NFI3 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
ZNF316A6NFI3 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
ZNF316A6NFI3 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
ZNF316A6NFI3 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
ZNF316A6NFI3 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC34.85■■■■□ 3.17
ZNF316A6NFI3 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC34.85■■■■□ 3.17
ZNF316A6NFI3 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
ZNF316A6NFI3 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
ZNF316A6NFI3 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
ZNF316A6NFI3 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.84■■■■□ 3.17
ZNF316A6NFI3 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
ZNF316A6NFI3 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
ZNF316A6NFI3 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
ZNF316A6NFI3 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC34.83■■■■□ 3.17
ZNF316A6NFI3 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC34.83■■■■□ 3.17
ZNF316A6NFI3 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.17
ZNF316A6NFI3 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC34.82■■■■□ 3.17
ZNF316A6NFI3 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.17
ZNF316A6NFI3 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.16
ZNF316A6NFI3 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.16
ZNF316A6NFI3 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
ZNF316A6NFI3 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC34.81■■■■□ 3.16
ZNF316A6NFI3 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
ZNF316A6NFI3 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
ZNF316A6NFI3 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC34.8■■■■□ 3.16
ZNF316A6NFI3 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC34.79■■■■□ 3.16
ZNF316A6NFI3 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
ZNF316A6NFI3 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
ZNF316A6NFI3 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC34.78■■■■□ 3.16
ZNF316A6NFI3 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
ZNF316A6NFI3 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
ZNF316A6NFI3 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.76■■■■□ 3.16
ZNF316A6NFI3 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.16
ZNF316A6NFI3 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
ZNF316A6NFI3 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC34.75■■■■□ 3.15
ZNF316A6NFI3 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
ZNF316A6NFI3 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
ZNF316A6NFI3 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
ZNF316A6NFI3 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
ZNF316A6NFI3 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
ZNF316A6NFI3 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
ZNF316A6NFI3 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
ZNF316A6NFI3 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
ZNF316A6NFI3 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.74■■■■□ 3.15
ZNF316A6NFI3 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
ZNF316A6NFI3 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
ZNF316A6NFI3 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
ZNF316A6NFI3 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
ZNF316A6NFI3 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC34.73■■■■□ 3.15
ZNF316A6NFI3 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.73■■■■□ 3.15
ZNF316A6NFI3 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC34.73■■■■□ 3.15
ZNF316A6NFI3 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC34.73■■■■□ 3.15
ZNF316A6NFI3 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
ZNF316A6NFI3 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.72■■■■□ 3.15
ZNF316A6NFI3 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
ZNF316A6NFI3 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC34.71■■■■□ 3.15
ZNF316A6NFI3 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
ZNF316A6NFI3 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
ZNF316A6NFI3 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC34.71■■■■□ 3.15
ZNF316A6NFI3 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
ZNF316A6NFI3 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
ZNF316A6NFI3 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
ZNF316A6NFI3 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.14
ZNF316A6NFI3 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.14
ZNF316A6NFI3 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
ZNF316A6NFI3 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
ZNF316A6NFI3 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
ZNF316A6NFI3 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.69■■■■□ 3.14
ZNF316A6NFI3 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
ZNF316A6NFI3 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC34.68■■■■□ 3.14
ZNF316A6NFI3 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
ZNF316A6NFI3 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
ZNF316A6NFI3 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC34.68■■■■□ 3.14
ZNF316A6NFI3 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
ZNF316A6NFI3 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
ZNF316A6NFI3 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC34.67■■■■□ 3.14
ZNF316A6NFI3 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
ZNF316A6NFI3 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
ZNF316A6NFI3 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC34.67■■■■□ 3.14
ZNF316A6NFI3 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
ZNF316A6NFI3 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.66■■■■□ 3.14
ZNF316A6NFI3 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
ZNF316A6NFI3 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
ZNF316A6NFI3 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC34.65■■■■□ 3.14
ZNF316A6NFI3 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC34.65■■■■□ 3.14
ZNF316A6NFI3 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC34.65■■■■□ 3.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms