Protein–RNA interactions for Protein: A6NFE2

SMCO2, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMCO2A6NFE2 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC28.24■■■□□ 2.11
SMCO2A6NFE2 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
SMCO2A6NFE2 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
SMCO2A6NFE2 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
SMCO2A6NFE2 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
SMCO2A6NFE2 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
SMCO2A6NFE2 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
SMCO2A6NFE2 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
SMCO2A6NFE2 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
SMCO2A6NFE2 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
SMCO2A6NFE2 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC28.22■■■□□ 2.11
SMCO2A6NFE2 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
SMCO2A6NFE2 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
SMCO2A6NFE2 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
SMCO2A6NFE2 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
SMCO2A6NFE2 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
SMCO2A6NFE2 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
SMCO2A6NFE2 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
SMCO2A6NFE2 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
SMCO2A6NFE2 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
SMCO2A6NFE2 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC28.2■■■□□ 2.1
SMCO2A6NFE2 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
SMCO2A6NFE2 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
SMCO2A6NFE2 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
SMCO2A6NFE2 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
SMCO2A6NFE2 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
SMCO2A6NFE2 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC28.18■■■□□ 2.1
SMCO2A6NFE2 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SMCO2A6NFE2 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SMCO2A6NFE2 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
SMCO2A6NFE2 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
SMCO2A6NFE2 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
SMCO2A6NFE2 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
SMCO2A6NFE2 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
SMCO2A6NFE2 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC28.16■■■□□ 2.1
SMCO2A6NFE2 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
SMCO2A6NFE2 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
SMCO2A6NFE2 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
SMCO2A6NFE2 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
SMCO2A6NFE2 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
SMCO2A6NFE2 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
SMCO2A6NFE2 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
SMCO2A6NFE2 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
SMCO2A6NFE2 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
SMCO2A6NFE2 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
SMCO2A6NFE2 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
SMCO2A6NFE2 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.09
SMCO2A6NFE2 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
SMCO2A6NFE2 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
SMCO2A6NFE2 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
SMCO2A6NFE2 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
SMCO2A6NFE2 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
SMCO2A6NFE2 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
SMCO2A6NFE2 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
SMCO2A6NFE2 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
SMCO2A6NFE2 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SMCO2A6NFE2 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
SMCO2A6NFE2 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
SMCO2A6NFE2 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
SMCO2A6NFE2 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SMCO2A6NFE2 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
SMCO2A6NFE2 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SMCO2A6NFE2 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
SMCO2A6NFE2 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
SMCO2A6NFE2 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
SMCO2A6NFE2 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SMCO2A6NFE2 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SMCO2A6NFE2 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
SMCO2A6NFE2 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
SMCO2A6NFE2 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
SMCO2A6NFE2 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
SMCO2A6NFE2 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SMCO2A6NFE2 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
SMCO2A6NFE2 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC28.09■■■□□ 2.09
SMCO2A6NFE2 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SMCO2A6NFE2 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SMCO2A6NFE2 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC28.08■■■□□ 2.09
SMCO2A6NFE2 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
SMCO2A6NFE2 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SMCO2A6NFE2 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SMCO2A6NFE2 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SMCO2A6NFE2 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
SMCO2A6NFE2 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
SMCO2A6NFE2 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
SMCO2A6NFE2 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
SMCO2A6NFE2 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SMCO2A6NFE2 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
SMCO2A6NFE2 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SMCO2A6NFE2 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SMCO2A6NFE2 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
SMCO2A6NFE2 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
SMCO2A6NFE2 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
SMCO2A6NFE2 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
SMCO2A6NFE2 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SMCO2A6NFE2 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
SMCO2A6NFE2 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
SMCO2A6NFE2 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
SMCO2A6NFE2 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SMCO2A6NFE2 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
SMCO2A6NFE2 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms