Protein–RNA interactions for Protein: A5PKW4

PSD, PH and SEC7 domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,024 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSDA5PKW4 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
PSDA5PKW4 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC32.05■■■□□ 2.72
PSDA5PKW4 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC32.05■■■□□ 2.72
PSDA5PKW4 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC32.04■■■□□ 2.72
PSDA5PKW4 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.04■■■□□ 2.72
PSDA5PKW4 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
PSDA5PKW4 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC32.03■■■□□ 2.72
PSDA5PKW4 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC32.03■■■□□ 2.72
PSDA5PKW4 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC32.03■■■□□ 2.72
PSDA5PKW4 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC32.03■■■□□ 2.72
PSDA5PKW4 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC32.03■■■□□ 2.72
PSDA5PKW4 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC32.03■■■□□ 2.72
PSDA5PKW4 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
PSDA5PKW4 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
PSDA5PKW4 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC32.02■■■□□ 2.72
PSDA5PKW4 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.72
PSDA5PKW4 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC32.01■■■□□ 2.72
PSDA5PKW4 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC32.01■■■□□ 2.71
PSDA5PKW4 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
PSDA5PKW4 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC32.01■■■□□ 2.71
PSDA5PKW4 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC32.01■■■□□ 2.71
PSDA5PKW4 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
PSDA5PKW4 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC32■■■□□ 2.71
PSDA5PKW4 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32■■■□□ 2.71
PSDA5PKW4 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32■■■□□ 2.71
PSDA5PKW4 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC32■■■□□ 2.71
PSDA5PKW4 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
PSDA5PKW4 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC31.99■■■□□ 2.71
PSDA5PKW4 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.99■■■□□ 2.71
PSDA5PKW4 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC31.99■■■□□ 2.71
PSDA5PKW4 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC31.99■■■□□ 2.71
PSDA5PKW4 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
PSDA5PKW4 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
PSDA5PKW4 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
PSDA5PKW4 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
PSDA5PKW4 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
PSDA5PKW4 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC31.98■■■□□ 2.71
PSDA5PKW4 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
PSDA5PKW4 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.98■■■□□ 2.71
PSDA5PKW4 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC31.97■■■□□ 2.71
PSDA5PKW4 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
PSDA5PKW4 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.97■■■□□ 2.71
PSDA5PKW4 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.96■■■□□ 2.71
PSDA5PKW4 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
PSDA5PKW4 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC31.96■■■□□ 2.71
PSDA5PKW4 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC31.96■■■□□ 2.71
PSDA5PKW4 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC31.95■■■□□ 2.71
PSDA5PKW4 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
PSDA5PKW4 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC31.94■■■□□ 2.7
PSDA5PKW4 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
PSDA5PKW4 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC31.94■■■□□ 2.7
PSDA5PKW4 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC31.94■■■□□ 2.7
PSDA5PKW4 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC31.94■■■□□ 2.7
PSDA5PKW4 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC31.94■■■□□ 2.7
PSDA5PKW4 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC31.94■■■□□ 2.7
PSDA5PKW4 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
PSDA5PKW4 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC31.93■■■□□ 2.7
PSDA5PKW4 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
PSDA5PKW4 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC31.93■■■□□ 2.7
PSDA5PKW4 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
PSDA5PKW4 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC31.93■■■□□ 2.7
PSDA5PKW4 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.92■■■□□ 2.7
PSDA5PKW4 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
PSDA5PKW4 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
PSDA5PKW4 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC31.91■■■□□ 2.7
PSDA5PKW4 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
PSDA5PKW4 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
PSDA5PKW4 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC31.9■■■□□ 2.7
PSDA5PKW4 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.9■■■□□ 2.7
PSDA5PKW4 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC31.9■■■□□ 2.7
PSDA5PKW4 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC31.9■■■□□ 2.7
PSDA5PKW4 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
PSDA5PKW4 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
PSDA5PKW4 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
PSDA5PKW4 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
PSDA5PKW4 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC31.9■■■□□ 2.7
PSDA5PKW4 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC31.9■■■□□ 2.7
PSDA5PKW4 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC31.9■■■□□ 2.7
PSDA5PKW4 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
PSDA5PKW4 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
PSDA5PKW4 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
PSDA5PKW4 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
PSDA5PKW4 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
PSDA5PKW4 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
PSDA5PKW4 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
PSDA5PKW4 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
PSDA5PKW4 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
PSDA5PKW4 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC31.87■■■□□ 2.69
PSDA5PKW4 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC31.87■■■□□ 2.69
PSDA5PKW4 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.87■■■□□ 2.69
PSDA5PKW4 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC31.87■■■□□ 2.69
PSDA5PKW4 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
PSDA5PKW4 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
PSDA5PKW4 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC31.86■■■□□ 2.69
PSDA5PKW4 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
PSDA5PKW4 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
PSDA5PKW4 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC31.85■■■□□ 2.69
PSDA5PKW4 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC31.85■■■□□ 2.69
PSDA5PKW4 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC31.85■■■□□ 2.69
PSDA5PKW4 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC31.85■■■□□ 2.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59 ms