Protein–RNA interactions for Protein: A2RRP1

NBAS, Neuroblastoma-amplified sequence, humanhuman

Predictions only

Length 2,371 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBASA2RRP1 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NBASA2RRP1 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NBASA2RRP1 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NBASA2RRP1 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NBASA2RRP1 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NBASA2RRP1 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NBASA2RRP1 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NBASA2RRP1 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NBASA2RRP1 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NBASA2RRP1 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NBASA2RRP1 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
NBASA2RRP1 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
NBASA2RRP1 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NBASA2RRP1 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NBASA2RRP1 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NBASA2RRP1 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NBASA2RRP1 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NBASA2RRP1 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NBASA2RRP1 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NBASA2RRP1 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NBASA2RRP1 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NBASA2RRP1 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NBASA2RRP1 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NBASA2RRP1 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NBASA2RRP1 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NBASA2RRP1 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NBASA2RRP1 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NBASA2RRP1 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NBASA2RRP1 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NBASA2RRP1 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NBASA2RRP1 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
NBASA2RRP1 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NBASA2RRP1 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NBASA2RRP1 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NBASA2RRP1 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
NBASA2RRP1 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NBASA2RRP1 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NBASA2RRP1 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NBASA2RRP1 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
NBASA2RRP1 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NBASA2RRP1 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NBASA2RRP1 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
NBASA2RRP1 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NBASA2RRP1 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NBASA2RRP1 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NBASA2RRP1 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NBASA2RRP1 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NBASA2RRP1 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NBASA2RRP1 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NBASA2RRP1 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NBASA2RRP1 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NBASA2RRP1 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NBASA2RRP1 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NBASA2RRP1 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NBASA2RRP1 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NBASA2RRP1 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NBASA2RRP1 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
NBASA2RRP1 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NBASA2RRP1 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NBASA2RRP1 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NBASA2RRP1 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NBASA2RRP1 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NBASA2RRP1 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
NBASA2RRP1 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
NBASA2RRP1 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
NBASA2RRP1 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
NBASA2RRP1 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NBASA2RRP1 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NBASA2RRP1 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NBASA2RRP1 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NBASA2RRP1 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
NBASA2RRP1 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NBASA2RRP1 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NBASA2RRP1 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NBASA2RRP1 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NBASA2RRP1 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NBASA2RRP1 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NBASA2RRP1 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NBASA2RRP1 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NBASA2RRP1 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
NBASA2RRP1 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NBASA2RRP1 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NBASA2RRP1 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
NBASA2RRP1 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NBASA2RRP1 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NBASA2RRP1 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NBASA2RRP1 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NBASA2RRP1 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NBASA2RRP1 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NBASA2RRP1 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NBASA2RRP1 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NBASA2RRP1 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NBASA2RRP1 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NBASA2RRP1 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NBASA2RRP1 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NBASA2RRP1 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NBASA2RRP1 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NBASA2RRP1 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NBASA2RRP1 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NBASA2RRP1 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.3 ms