Protein–RNA interactions for Protein: A0ZSE6

TMEM30CP, Cell cycle control protein 50C, humanhuman

Predictions only

Length 113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM30CPA0ZSE6 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TMEM30CPA0ZSE6 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TMEM30CPA0ZSE6 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TMEM30CPA0ZSE6 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TMEM30CPA0ZSE6 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TMEM30CPA0ZSE6 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TMEM30CPA0ZSE6 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TMEM30CPA0ZSE6 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TMEM30CPA0ZSE6 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TMEM30CPA0ZSE6 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TMEM30CPA0ZSE6 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TMEM30CPA0ZSE6 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TMEM30CPA0ZSE6 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TMEM30CPA0ZSE6 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TMEM30CPA0ZSE6 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TMEM30CPA0ZSE6 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TMEM30CPA0ZSE6 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TMEM30CPA0ZSE6 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TMEM30CPA0ZSE6 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TMEM30CPA0ZSE6 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TMEM30CPA0ZSE6 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TMEM30CPA0ZSE6 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TMEM30CPA0ZSE6 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TMEM30CPA0ZSE6 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TMEM30CPA0ZSE6 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TMEM30CPA0ZSE6 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TMEM30CPA0ZSE6 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TMEM30CPA0ZSE6 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TMEM30CPA0ZSE6 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TMEM30CPA0ZSE6 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TMEM30CPA0ZSE6 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TMEM30CPA0ZSE6 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
TMEM30CPA0ZSE6 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
TMEM30CPA0ZSE6 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TMEM30CPA0ZSE6 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TMEM30CPA0ZSE6 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TMEM30CPA0ZSE6 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TMEM30CPA0ZSE6 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TMEM30CPA0ZSE6 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TMEM30CPA0ZSE6 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TMEM30CPA0ZSE6 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TMEM30CPA0ZSE6 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TMEM30CPA0ZSE6 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TMEM30CPA0ZSE6 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
TMEM30CPA0ZSE6 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TMEM30CPA0ZSE6 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TMEM30CPA0ZSE6 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TMEM30CPA0ZSE6 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
TMEM30CPA0ZSE6 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
TMEM30CPA0ZSE6 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TMEM30CPA0ZSE6 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TMEM30CPA0ZSE6 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TMEM30CPA0ZSE6 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
TMEM30CPA0ZSE6 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
TMEM30CPA0ZSE6 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TMEM30CPA0ZSE6 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
TMEM30CPA0ZSE6 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
TMEM30CPA0ZSE6 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TMEM30CPA0ZSE6 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
TMEM30CPA0ZSE6 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
TMEM30CPA0ZSE6 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TMEM30CPA0ZSE6 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TMEM30CPA0ZSE6 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TMEM30CPA0ZSE6 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TMEM30CPA0ZSE6 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
TMEM30CPA0ZSE6 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TMEM30CPA0ZSE6 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TMEM30CPA0ZSE6 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TMEM30CPA0ZSE6 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TMEM30CPA0ZSE6 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TMEM30CPA0ZSE6 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TMEM30CPA0ZSE6 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TMEM30CPA0ZSE6 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TMEM30CPA0ZSE6 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TMEM30CPA0ZSE6 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TMEM30CPA0ZSE6 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TMEM30CPA0ZSE6 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TMEM30CPA0ZSE6 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TMEM30CPA0ZSE6 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
TMEM30CPA0ZSE6 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TMEM30CPA0ZSE6 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TMEM30CPA0ZSE6 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TMEM30CPA0ZSE6 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TMEM30CPA0ZSE6 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TMEM30CPA0ZSE6 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TMEM30CPA0ZSE6 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TMEM30CPA0ZSE6 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TMEM30CPA0ZSE6 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TMEM30CPA0ZSE6 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TMEM30CPA0ZSE6 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TMEM30CPA0ZSE6 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TMEM30CPA0ZSE6 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
TMEM30CPA0ZSE6 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
TMEM30CPA0ZSE6 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TMEM30CPA0ZSE6 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TMEM30CPA0ZSE6 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TMEM30CPA0ZSE6 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TMEM30CPA0ZSE6 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TMEM30CPA0ZSE6 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TMEM30CPA0ZSE6 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms