Protein–RNA interactions for Protein: A0AVK6

E2F8, Transcription factor E2F8, humanhuman

Predictions only

Length 867 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F8A0AVK6 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
E2F8A0AVK6 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
E2F8A0AVK6 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
E2F8A0AVK6 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC25.64■■□□□ 1.7
E2F8A0AVK6 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
E2F8A0AVK6 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
E2F8A0AVK6 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
E2F8A0AVK6 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
E2F8A0AVK6 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
E2F8A0AVK6 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
E2F8A0AVK6 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
E2F8A0AVK6 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
E2F8A0AVK6 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
E2F8A0AVK6 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
E2F8A0AVK6 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
E2F8A0AVK6 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
E2F8A0AVK6 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
E2F8A0AVK6 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
E2F8A0AVK6 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
E2F8A0AVK6 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
E2F8A0AVK6 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
E2F8A0AVK6 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
E2F8A0AVK6 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
E2F8A0AVK6 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
E2F8A0AVK6 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
E2F8A0AVK6 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
E2F8A0AVK6 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
E2F8A0AVK6 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
E2F8A0AVK6 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
E2F8A0AVK6 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
E2F8A0AVK6 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
E2F8A0AVK6 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
E2F8A0AVK6 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
E2F8A0AVK6 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
E2F8A0AVK6 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
E2F8A0AVK6 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
E2F8A0AVK6 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
E2F8A0AVK6 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
E2F8A0AVK6 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
E2F8A0AVK6 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
E2F8A0AVK6 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
E2F8A0AVK6 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
E2F8A0AVK6 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
E2F8A0AVK6 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
E2F8A0AVK6 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
E2F8A0AVK6 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
E2F8A0AVK6 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
E2F8A0AVK6 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
E2F8A0AVK6 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
E2F8A0AVK6 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
E2F8A0AVK6 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
E2F8A0AVK6 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
E2F8A0AVK6 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
E2F8A0AVK6 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
E2F8A0AVK6 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
E2F8A0AVK6 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
E2F8A0AVK6 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
E2F8A0AVK6 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
E2F8A0AVK6 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
E2F8A0AVK6 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
E2F8A0AVK6 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
E2F8A0AVK6 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
E2F8A0AVK6 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
E2F8A0AVK6 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
E2F8A0AVK6 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
E2F8A0AVK6 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
E2F8A0AVK6 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
E2F8A0AVK6 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
E2F8A0AVK6 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
E2F8A0AVK6 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
E2F8A0AVK6 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
E2F8A0AVK6 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
E2F8A0AVK6 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
E2F8A0AVK6 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
E2F8A0AVK6 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
E2F8A0AVK6 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
E2F8A0AVK6 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
E2F8A0AVK6 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
E2F8A0AVK6 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
E2F8A0AVK6 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
E2F8A0AVK6 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
E2F8A0AVK6 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
E2F8A0AVK6 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
E2F8A0AVK6 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
E2F8A0AVK6 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
E2F8A0AVK6 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
E2F8A0AVK6 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC25.5■■□□□ 1.67
E2F8A0AVK6 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
E2F8A0AVK6 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
E2F8A0AVK6 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
E2F8A0AVK6 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
E2F8A0AVK6 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
E2F8A0AVK6 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
E2F8A0AVK6 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
E2F8A0AVK6 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
E2F8A0AVK6 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
E2F8A0AVK6 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
E2F8A0AVK6 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
E2F8A0AVK6 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
E2F8A0AVK6 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms