Protein–RNA interactions for Protein: A0AVI4

TMEM129, E3 ubiquitin-protein ligase TM129, humanhuman

Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM129A0AVI4 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
TMEM129A0AVI4 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
TMEM129A0AVI4 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
TMEM129A0AVI4 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
TMEM129A0AVI4 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
TMEM129A0AVI4 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
TMEM129A0AVI4 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
TMEM129A0AVI4 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
TMEM129A0AVI4 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
TMEM129A0AVI4 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TMEM129A0AVI4 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TMEM129A0AVI4 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TMEM129A0AVI4 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMEM129A0AVI4 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMEM129A0AVI4 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMEM129A0AVI4 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMEM129A0AVI4 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMEM129A0AVI4 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMEM129A0AVI4 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMEM129A0AVI4 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMEM129A0AVI4 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMEM129A0AVI4 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMEM129A0AVI4 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMEM129A0AVI4 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMEM129A0AVI4 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMEM129A0AVI4 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMEM129A0AVI4 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMEM129A0AVI4 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
TMEM129A0AVI4 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMEM129A0AVI4 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMEM129A0AVI4 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMEM129A0AVI4 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMEM129A0AVI4 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMEM129A0AVI4 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMEM129A0AVI4 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMEM129A0AVI4 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMEM129A0AVI4 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMEM129A0AVI4 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMEM129A0AVI4 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMEM129A0AVI4 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMEM129A0AVI4 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMEM129A0AVI4 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMEM129A0AVI4 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMEM129A0AVI4 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMEM129A0AVI4 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TMEM129A0AVI4 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TMEM129A0AVI4 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMEM129A0AVI4 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMEM129A0AVI4 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMEM129A0AVI4 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMEM129A0AVI4 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMEM129A0AVI4 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMEM129A0AVI4 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMEM129A0AVI4 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMEM129A0AVI4 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMEM129A0AVI4 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMEM129A0AVI4 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMEM129A0AVI4 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
TMEM129A0AVI4 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMEM129A0AVI4 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMEM129A0AVI4 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMEM129A0AVI4 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMEM129A0AVI4 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMEM129A0AVI4 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMEM129A0AVI4 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMEM129A0AVI4 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMEM129A0AVI4 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMEM129A0AVI4 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMEM129A0AVI4 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
TMEM129A0AVI4 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMEM129A0AVI4 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMEM129A0AVI4 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMEM129A0AVI4 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TMEM129A0AVI4 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TMEM129A0AVI4 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TMEM129A0AVI4 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
TMEM129A0AVI4 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TMEM129A0AVI4 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TMEM129A0AVI4 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMEM129A0AVI4 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMEM129A0AVI4 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMEM129A0AVI4 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMEM129A0AVI4 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TMEM129A0AVI4 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TMEM129A0AVI4 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TMEM129A0AVI4 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TMEM129A0AVI4 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TMEM129A0AVI4 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TMEM129A0AVI4 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TMEM129A0AVI4 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TMEM129A0AVI4 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TMEM129A0AVI4 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
TMEM129A0AVI4 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TMEM129A0AVI4 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TMEM129A0AVI4 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TMEM129A0AVI4 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TMEM129A0AVI4 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TMEM129A0AVI4 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TMEM129A0AVI4 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TMEM129A0AVI4 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.7 ms