Protein–RNA interactions for Protein: A0A087X0T9

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A087X0T9 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
A0A087X0T9 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
A0A087X0T9 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
A0A087X0T9 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
A0A087X0T9 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
A0A087X0T9 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
A0A087X0T9 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
A0A087X0T9 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
A0A087X0T9 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
A0A087X0T9 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
A0A087X0T9 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
A0A087X0T9 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
A0A087X0T9 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
A0A087X0T9 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
A0A087X0T9 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
A0A087X0T9 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
A0A087X0T9 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
A0A087X0T9 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
A0A087X0T9 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
A0A087X0T9 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
A0A087X0T9 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
A0A087X0T9 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
A0A087X0T9 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
A0A087X0T9 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
A0A087X0T9 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC26.17■■□□□ 1.78
A0A087X0T9 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
A0A087X0T9 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
A0A087X0T9 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
A0A087X0T9 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
A0A087X0T9 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
A0A087X0T9 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
A0A087X0T9 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
A0A087X0T9 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
A0A087X0T9 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
A0A087X0T9 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
A0A087X0T9 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
A0A087X0T9 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
A0A087X0T9 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
A0A087X0T9 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
A0A087X0T9 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
A0A087X0T9 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
A0A087X0T9 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
A0A087X0T9 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
A0A087X0T9 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
A0A087X0T9 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
A0A087X0T9 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
A0A087X0T9 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
A0A087X0T9 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC26.13■■□□□ 1.77
A0A087X0T9 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
A0A087X0T9 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
A0A087X0T9 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
A0A087X0T9 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
A0A087X0T9 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
A0A087X0T9 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
A0A087X0T9 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
A0A087X0T9 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
A0A087X0T9 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
A0A087X0T9 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
A0A087X0T9 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
A0A087X0T9 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
A0A087X0T9 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
A0A087X0T9 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
A0A087X0T9 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
A0A087X0T9 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
A0A087X0T9 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
A0A087X0T9 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
A0A087X0T9 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
A0A087X0T9 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
A0A087X0T9 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
A0A087X0T9 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
A0A087X0T9 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
A0A087X0T9 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
A0A087X0T9 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
A0A087X0T9 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
A0A087X0T9 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.77
A0A087X0T9 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
A0A087X0T9 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
A0A087X0T9 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
A0A087X0T9 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
A0A087X0T9 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
A0A087X0T9 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
A0A087X0T9 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
A0A087X0T9 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
A0A087X0T9 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
A0A087X0T9 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
A0A087X0T9 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
A0A087X0T9 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
A0A087X0T9 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
A0A087X0T9 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
A0A087X0T9 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
A0A087X0T9 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
A0A087X0T9 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
A0A087X0T9 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
A0A087X0T9 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
A0A087X0T9 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
A0A087X0T9 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
A0A087X0T9 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
A0A087X0T9 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
A0A087X0T9 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
A0A087X0T9 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.5 ms