Protein–RNA interactions for Protein: V9GY48

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
V9GY48 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
V9GY48 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
V9GY48 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
V9GY48 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
V9GY48 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
V9GY48 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
V9GY48 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
V9GY48 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
V9GY48 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
V9GY48 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
V9GY48 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
V9GY48 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
V9GY48 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
V9GY48 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
V9GY48 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
V9GY48 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
V9GY48 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
V9GY48 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
V9GY48 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
V9GY48 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
V9GY48 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
V9GY48 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
V9GY48 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
V9GY48 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
V9GY48 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
V9GY48 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
V9GY48 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
V9GY48 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
V9GY48 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
V9GY48 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
V9GY48 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
V9GY48 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
V9GY48 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
V9GY48 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
V9GY48 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
V9GY48 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC20.59■□□□□ 0.89
V9GY48 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
V9GY48 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
V9GY48 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
V9GY48 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
V9GY48 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
V9GY48 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
V9GY48 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
V9GY48 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
V9GY48 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
V9GY48 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
V9GY48 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
V9GY48 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
V9GY48 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
V9GY48 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
V9GY48 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
V9GY48 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
V9GY48 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
V9GY48 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
V9GY48 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
V9GY48 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
V9GY48 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
V9GY48 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
V9GY48 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
V9GY48 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
V9GY48 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
V9GY48 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
V9GY48 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
V9GY48 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
V9GY48 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
V9GY48 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
V9GY48 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
V9GY48 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
V9GY48 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
V9GY48 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
V9GY48 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
V9GY48 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
V9GY48 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
V9GY48 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
V9GY48 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.88
V9GY48 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
V9GY48 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
V9GY48 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
V9GY48 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
V9GY48 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
V9GY48 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
V9GY48 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
V9GY48 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
V9GY48 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
V9GY48 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
V9GY48 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
V9GY48 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
V9GY48 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
V9GY48 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
V9GY48 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
V9GY48 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
V9GY48 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
V9GY48 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
V9GY48 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
V9GY48 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
V9GY48 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
V9GY48 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
V9GY48 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
V9GY48 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
V9GY48 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms