Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y397

ZDHHC9, Palmitoyltransferase ZDHHC9, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZDHHC9Q9Y397 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ZDHHC9Q9Y397 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ZDHHC9Q9Y397 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ZDHHC9Q9Y397 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ZDHHC9Q9Y397 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ZDHHC9Q9Y397 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ZDHHC9Q9Y397 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ZDHHC9Q9Y397 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ZDHHC9Q9Y397 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ZDHHC9Q9Y397 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ZDHHC9Q9Y397 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ZDHHC9Q9Y397 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ZDHHC9Q9Y397 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ZDHHC9Q9Y397 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ZDHHC9Q9Y397 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ZDHHC9Q9Y397 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ZDHHC9Q9Y397 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ZDHHC9Q9Y397 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ZDHHC9Q9Y397 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ZDHHC9Q9Y397 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ZDHHC9Q9Y397 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ZDHHC9Q9Y397 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ZDHHC9Q9Y397 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ZDHHC9Q9Y397 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ZDHHC9Q9Y397 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ZDHHC9Q9Y397 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ZDHHC9Q9Y397 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ZDHHC9Q9Y397 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ZDHHC9Q9Y397 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
ZDHHC9Q9Y397 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ZDHHC9Q9Y397 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ZDHHC9Q9Y397 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ZDHHC9Q9Y397 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ZDHHC9Q9Y397 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ZDHHC9Q9Y397 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ZDHHC9Q9Y397 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ZDHHC9Q9Y397 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
ZDHHC9Q9Y397 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ZDHHC9Q9Y397 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ZDHHC9Q9Y397 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
ZDHHC9Q9Y397 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ZDHHC9Q9Y397 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ZDHHC9Q9Y397 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
ZDHHC9Q9Y397 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
ZDHHC9Q9Y397 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
ZDHHC9Q9Y397 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ZDHHC9Q9Y397 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ZDHHC9Q9Y397 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ZDHHC9Q9Y397 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ZDHHC9Q9Y397 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ZDHHC9Q9Y397 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ZDHHC9Q9Y397 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ZDHHC9Q9Y397 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ZDHHC9Q9Y397 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ZDHHC9Q9Y397 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ZDHHC9Q9Y397 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ZDHHC9Q9Y397 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ZDHHC9Q9Y397 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ZDHHC9Q9Y397 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ZDHHC9Q9Y397 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ZDHHC9Q9Y397 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ZDHHC9Q9Y397 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ZDHHC9Q9Y397 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ZDHHC9Q9Y397 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ZDHHC9Q9Y397 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ZDHHC9Q9Y397 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ZDHHC9Q9Y397 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ZDHHC9Q9Y397 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ZDHHC9Q9Y397 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ZDHHC9Q9Y397 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ZDHHC9Q9Y397 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ZDHHC9Q9Y397 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ZDHHC9Q9Y397 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
ZDHHC9Q9Y397 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ZDHHC9Q9Y397 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ZDHHC9Q9Y397 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ZDHHC9Q9Y397 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ZDHHC9Q9Y397 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
ZDHHC9Q9Y397 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ZDHHC9Q9Y397 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ZDHHC9Q9Y397 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ZDHHC9Q9Y397 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ZDHHC9Q9Y397 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ZDHHC9Q9Y397 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ZDHHC9Q9Y397 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ZDHHC9Q9Y397 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ZDHHC9Q9Y397 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ZDHHC9Q9Y397 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ZDHHC9Q9Y397 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ZDHHC9Q9Y397 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ZDHHC9Q9Y397 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ZDHHC9Q9Y397 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ZDHHC9Q9Y397 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ZDHHC9Q9Y397 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ZDHHC9Q9Y397 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ZDHHC9Q9Y397 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ZDHHC9Q9Y397 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ZDHHC9Q9Y397 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ZDHHC9Q9Y397 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ZDHHC9Q9Y397 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms